RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621817.1

FAM58A-209, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, human

TSL 3

Gene FAM58A, Length 916 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM58A-209	ENST00000621817	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		44.04	■■■■■ 4.64
FAM58A-209	ENST00000621817	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		44.03	■■■■■ 4.64
FAM58A-209	ENST00000621817	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		44.02	■■■■■ 4.64
FAM58A-209	ENST00000621817	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	43.99	■■■■■ 4.63
FAM58A-209	ENST00000621817	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		43.98	■■■■■ 4.63
FAM58A-209	ENST00000621817	KCNA6	P17658	529 aa		43.98	■■■■■ 4.63
FAM58A-209	ENST00000621817	HSPA1L	P34931	641 aa		43.97	■■■■■ 4.63
FAM58A-209	ENST00000621817	HFM1	A2PYH4	1435 aa		43.96	■■■■■ 4.63
FAM58A-209	ENST00000621817	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.93	■■■■■ 4.62
FAM58A-209	ENST00000621817	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.92	■■■■■ 4.62
FAM58A-209	ENST00000621817	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	43.92	■■■■■ 4.62
FAM58A-209	ENST00000621817	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.9	■■■■■ 4.62
FAM58A-209	ENST00000621817	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.89	■■■■■ 4.62
FAM58A-209	ENST00000621817	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.89	■■■■■ 4.62
FAM58A-209	ENST00000621817	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.87	■■■■■ 4.61
FAM58A-209	ENST00000621817	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.85	■■■■■ 4.61
FAM58A-209	ENST00000621817	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.84	■■■■■ 4.61
FAM58A-209	ENST00000621817	TRPM2	O94759	1503 aa		43.83	■■■■■ 4.61
FAM58A-209	ENST00000621817	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.82	■■■■■ 4.61
FAM58A-209	ENST00000621817	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.81	■■■■■ 4.6
FAM58A-209	ENST00000621817	CLTCL1	P53675	1640 aa		43.81	■■■■■ 4.6
FAM58A-209	ENST00000621817	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.79	■■■■■ 4.6
FAM58A-209	ENST00000621817	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.77	■■■■■ 4.6
FAM58A-209	ENST00000621817	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.76	■■■■■ 4.6
FAM58A-209	ENST00000621817	ILDR2	Q71H61	639 aa		43.74	■■■■■ 4.59
FAM58A-209	ENST00000621817	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.73	■■■■■ 4.59
FAM58A-209	ENST00000621817	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.7	■■■■■ 4.59
FAM58A-209	ENST00000621817	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	43.69	■■■■■ 4.58
FAM58A-209	ENST00000621817	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
FAM58A-209	ENST00000621817	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.68	■■■■■ 4.58
FAM58A-209	ENST00000621817	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		43.68	■■■■■ 4.58
FAM58A-209	ENST00000621817	KIF1B	O60333	1816 aa		43.68	■■■■■ 4.58
FAM58A-209	ENST00000621817	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.65	■■■■■ 4.58
FAM58A-209	ENST00000621817	TRIM52	Q96A61	297 aa		43.63	■■■■■ 4.57
FAM58A-209	ENST00000621817	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		43.61	■■■■■ 4.57
FAM58A-209	ENST00000621817	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		43.59	■■■■■ 4.57
FAM58A-209	ENST00000621817	MSH6	P52701	1360 aa		43.59	■■■■■ 4.57
FAM58A-209	ENST00000621817	PTPRU	Q92729	1446 aa		43.58	■■■■■ 4.57
FAM58A-209	ENST00000621817	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	43.56	■■■■■ 4.56
FAM58A-209	ENST00000621817	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	43.56	■■■■■ 4.56
FAM58A-209	ENST00000621817	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
FAM58A-209	ENST00000621817	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	43.47	■■■■■ 4.55
FAM58A-209	ENST00000621817	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		43.46	■■■■■ 4.55
FAM58A-209	ENST00000621817	SLAIN2	Q9P270	581 aa		43.43	■■■■■ 4.54
FAM58A-209	ENST00000621817	MET	P08581	1390 aa		43.42	■■■■■ 4.54
FAM58A-209	ENST00000621817	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	43.4	■■■■■ 4.54
FAM58A-209	ENST00000621817	PPL	O60437	1756 aa		43.4	■■■■■ 4.54
FAM58A-209	ENST00000621817	SOCS7	O14512	581 aa		43.36	■■■■■ 4.53
FAM58A-209	ENST00000621817	FOXD1	Q16676	465 aa		43.36	■■■■■ 4.53
FAM58A-209	ENST00000621817	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		43.36	■■■■■ 4.53
FAM58A-209	ENST00000621817	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.34	■■■■■ 4.53
FAM58A-209	ENST00000621817	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		43.32	■■■■■ 4.53
FAM58A-209	ENST00000621817	PHLPP1	O60346	1717 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	C14orf37	Q86TY3	774 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	DCC	P43146	1447 aa		43.3	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		43.29	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		43.29	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.26	■■■■■ 4.52
FAM58A-209	ENST00000621817	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43.25	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	43.25	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	43.23	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	ATF3	P18847	181 aa		43.23	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		43.22	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	IFT172	Q9UG01	1749 aa		43.22	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	43.21	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		43.2	■■■■■ 4.51
FAM58A-209	ENST00000621817	PTCH1	Q13635	1447 aa		43.18	■■■■■ 4.5
FAM58A-209	ENST00000621817	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	43.18	■■■■■ 4.5
FAM58A-209	ENST00000621817	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		43.18	■■■■■ 4.5
FAM58A-209	ENST00000621817	MST1R	Q04912	1400 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FAM58A-209	ENST00000621817	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		43.13	■■■■■ 4.49
FAM58A-209	ENST00000621817	JCAD	Q9P266	1359 aa		43.1	■■■■■ 4.49
FAM58A-209	ENST00000621817	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		43.08	■■■■■ 4.49
FAM58A-209	ENST00000621817	BRINP3	Q76B58	766 aa		43.08	■■■■■ 4.49
FAM58A-209	ENST00000621817	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
FAM58A-209	ENST00000621817	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		43.07	■■■■■ 4.48
FAM58A-209	ENST00000621817	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM58A-209	ENST00000621817	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM58A-209	ENST00000621817	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		43.03	■■■■■ 4.48
FAM58A-209	ENST00000621817	RGL3	Q3MIN7	710 aa		43.02	■■■■■ 4.48
FAM58A-209	ENST00000621817	SHPRH	Q149N8	1683 aa		43.02	■■■■■ 4.48
FAM58A-209	ENST00000621817	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.98	■■■■■ 4.47
FAM58A-209	ENST00000621817	TECPR2	O15040	1411 aa		42.93	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.91	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	LRP6	O75581	1613 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	LAMC1	P11047	1609 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FAM58A-209	ENST00000621817	MYOM2	P54296	1465 aa		42.87	■■■■■ 4.45
FAM58A-209	ENST00000621817	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
FAM58A-209	ENST00000621817	HRC	P23327	699 aa		42.85	■■■■■ 4.45
FAM58A-209	ENST00000621817	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.84	■■■■■ 4.45
FAM58A-209	ENST00000621817	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.82	■■■■■ 4.45
FAM58A-209	ENST00000621817	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.8	■■■■■ 4.44
FAM58A-209	ENST00000621817	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
FAM58A-209	ENST00000621817	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.75	■■■■■ 4.43
FAM58A-209	ENST00000621817	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
FAM58A-209	ENST00000621817	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43

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