RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 ALKQ9UM73 1620 aa35.66■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 BCANQ96GW7 911 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.63■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 HSPA1LP34931 641 aa35.62■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 HFM1A2PYH4 1435 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.58■■■■□ 3.29
PPP1CC-211ENST00000620030 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
PPP1CC-211ENST00000620030 TBX22Q9Y458 520 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CC-211ENST00000620030 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM94Q12767 1356 aa35.53■■■■□ 3.28
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM52Q96A61 297 aa35.5■■■■□ 3.27
PPP1CC-211ENST00000620030 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PPP1CC-211ENST00000620030 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
PPP1CC-211ENST00000620030 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CC-211ENST00000620030 NWD1Q149M9 1564 aa35.46■■■■□ 3.27
PPP1CC-211ENST00000620030 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP1CC-211ENST00000620030 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
PPP1CC-211ENST00000620030 ILDR2Q71H61 639 aa35.39■■■■□ 3.26
PPP1CC-211ENST00000620030 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
PPP1CC-211ENST00000620030 TRPM2O94759 1503 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-211ENST00000620030 PIK3R4Q99570 1358 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CC-211ENST00000620030 CLTCL1P53675 1640 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CC-211ENST00000620030 DIP2AQ14689 1571 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP1CC-211ENST00000620030 MSH6P52701 1360 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CC-211ENST00000620030 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CC-211ENST00000620030 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP1CC-211ENST00000620030 PTPRUQ92729 1446 aa35.27■■■■□ 3.24
PPP1CC-211ENST00000620030 SLAIN2Q9P270 581 aa35.25■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 FOXD1Q16676 465 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.23■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 METP08581 1390 aa35.2■■■■□ 3.23
PPP1CC-211ENST00000620030 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.19■■■■□ 3.22
PPP1CC-211ENST00000620030 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-211ENST00000620030 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-211ENST00000620030 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-211ENST00000620030 KIF1BO60333 1816 aa35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-211ENST00000620030 C14orf37Q86TY3 774 aa35.16■■■■□ 3.22
PPP1CC-211ENST00000620030 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.13■■■■□ 3.21
PPP1CC-211ENST00000620030 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
PPP1CC-211ENST00000620030 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.12■■■■□ 3.21
PPP1CC-211ENST00000620030 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.11■■■■□ 3.21
PPP1CC-211ENST00000620030 ATF3P18847 181 aa35.08■■■■□ 3.21
PPP1CC-211ENST00000620030 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
PPP1CC-211ENST00000620030 SOCS7O14512 581 aa35.07■■■■□ 3.2
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.05■■■■□ 3.2
PPP1CC-211ENST00000620030 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35■■■■□ 3.19
PPP1CC-211ENST00000620030 RGL3Q3MIN7 710 aa35■■■■□ 3.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
PPP1CC-211ENST00000620030 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.99■■■■□ 3.19
PPP1CC-211ENST00000620030 DCCP43146 1447 aa34.98■■■■□ 3.19
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.96■■■■□ 3.19
PPP1CC-211ENST00000620030 PPLO60437 1756 aa34.95■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 BRINP3Q76B58 766 aa34.92■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.9■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.9■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 PHLPP1O60346 1717 aa34.89■■■■□ 3.18
PPP1CC-211ENST00000620030 MST1RQ04912 1400 aa34.88■■■■□ 3.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PTCH1Q13635 1447 aa34.88■■■■□ 3.17
PPP1CC-211ENST00000620030 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.88■■■■□ 3.17
PPP1CC-211ENST00000620030 JCADQ9P266 1359 aa34.87■■■■□ 3.17
PPP1CC-211ENST00000620030 HRCP23327 699 aa34.85■■■■□ 3.17
PPP1CC-211ENST00000620030 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
PPP1CC-211ENST00000620030 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.16
PPP1CC-211ENST00000620030 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.76■■■■□ 3.16
PPP1CC-211ENST00000620030 IFT172Q9UG01 1749 aa34.76■■■■□ 3.16
PPP1CC-211ENST00000620030 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.76■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PIK3C2GO75747 1445 aa34.75■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.74■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 STK26Q9P289 416 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.73■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCC11Q96J66 1382 aa34.72■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 C1orf167Q5SNV9 1468 aa34.71■■■■□ 3.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 TECPR2O15040 1411 aa34.69■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 POTEAQ6S8J7 498 aa34.68■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.68■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.67■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ORAI2Q96SN7 254 aa34.66■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.65■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 MYOM2P54296 1465 aa34.64■■■■□ 3.14
PPP1CC-211ENST00000620030 LRP6O75581 1613 aa34.63■■■■□ 3.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SIRT1Q96EB6 747 aa34.62■■■■□ 3.13
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