RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619976.1

SYNRG-227, Transcript of synergin gamma, humanhuman

TSL 2

Gene SYNRG, Length 1,375 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRG-227ENST00000619976 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.79■■■■■ 4.28
SYNRG-227ENST00000619976 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
SYNRG-227ENST00000619976 BCANQ96GW7 911 aa41.76■■■■■ 4.28
SYNRG-227ENST00000619976 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.75■■■■■ 4.27
SYNRG-227ENST00000619976 TOM1O60784 492 aa41.75■■■■■ 4.27
SYNRG-227ENST00000619976 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.27
SYNRG-227ENST00000619976 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
SYNRG-227ENST00000619976 KCNA6P17658 529 aa41.68■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 TRPM2O94759 1503 aa41.67■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 CLTCL1P53675 1640 aa41.65■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 PIP4K2BP78356 416 aa41.64■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
SYNRG-227ENST00000619976 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
SYNRG-227ENST00000619976 ALKQ9UM73 1620 aa41.62■■■■■ 4.25
SYNRG-227ENST00000619976 NWD1Q149M9 1564 aa41.59■■■■■ 4.25
SYNRG-227ENST00000619976 TBX22Q9Y458 520 aa41.57■■■■■ 4.25
SYNRG-227ENST00000619976 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 KIF1BO60333 1816 aa41.55■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.54■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 TMEM94Q12767 1356 aa41.53■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 DIP2AQ14689 1571 aa41.52■■■■■ 4.24
SYNRG-227ENST00000619976 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.47■■■■■ 4.23
SYNRG-227ENST00000619976 HSPA1LP34931 641 aa41.45■■■■■ 4.23
SYNRG-227ENST00000619976 FOXD1Q16676 465 aa41.45■■■■■ 4.23
SYNRG-227ENST00000619976 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
SYNRG-227ENST00000619976 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.44■■■■■ 4.22
SYNRG-227ENST00000619976 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.44■■■■■ 4.22
SYNRG-227ENST00000619976 PIK3R4Q99570 1358 aa41.42■■■■■ 4.22
SYNRG-227ENST00000619976 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
SYNRG-227ENST00000619976 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.4■■■■■ 4.22
SYNRG-227ENST00000619976 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.4■■■■■ 4.22
SYNRG-227ENST00000619976 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.31■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 PTPRUQ92729 1446 aa41.3■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 MSH6P52701 1360 aa41.3■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.29■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.29■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.29■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.28■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.26■■■■■ 4.2
SYNRG-227ENST00000619976 METP08581 1390 aa41.23■■■■■ 4.19
SYNRG-227ENST00000619976 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.23■■■■■ 4.19
SYNRG-227ENST00000619976 PPLO60437 1756 aa41.22■■■■■ 4.19
SYNRG-227ENST00000619976 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
SYNRG-227ENST00000619976 C14orf37Q86TY3 774 aa41.19■■■■■ 4.18
SYNRG-227ENST00000619976 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.15■■■■■ 4.18
SYNRG-227ENST00000619976 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.14■■■■■ 4.18
SYNRG-227ENST00000619976 SLAIN2Q9P270 581 aa41.13■■■■■ 4.18
SYNRG-227ENST00000619976 RGL3Q3MIN7 710 aa41.12■■■■■ 4.17
SYNRG-227ENST00000619976 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
SYNRG-227ENST00000619976 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.12■■■■■ 4.17
SYNRG-227ENST00000619976 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
SYNRG-227ENST00000619976 HRCP23327 699 aa41.06■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.05■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 IFT172Q9UG01 1749 aa41.05■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 ATF3P18847 181 aa41.04■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.03■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.02■■■■■ 4.16
SYNRG-227ENST00000619976 DCCP43146 1447 aa40.97■■■■■ 4.15
SYNRG-227ENST00000619976 PTCH1Q13635 1447 aa40.94■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 ILDR2Q71H61 639 aa40.93■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.92■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.9■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 PHLPP1O60346 1717 aa40.9■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.89■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.89■■■■■ 4.14
SYNRG-227ENST00000619976 PIK3C2GO75747 1445 aa40.87■■■■■ 4.13
SYNRG-227ENST00000619976 MST1RQ04912 1400 aa40.82■■■■■ 4.13
SYNRG-227ENST00000619976 BRINP3Q76B58 766 aa40.8■■■■■ 4.12
SYNRG-227ENST00000619976 MYOM2P54296 1465 aa40.79■■■■■ 4.12
SYNRG-227ENST00000619976 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.77■■■■■ 4.12
SYNRG-227ENST00000619976 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
SYNRG-227ENST00000619976 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
SYNRG-227ENST00000619976 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.77■■■■■ 4.12
SYNRG-227ENST00000619976 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.75■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 STK26Q9P289 416 aa40.75■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 TECPR2O15040 1411 aa40.72■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 JCADQ9P266 1359 aa40.71■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 ABCC11Q96J66 1382 aa40.7■■■■■ 4.11
SYNRG-227ENST00000619976 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.69■■■■■ 4.1
SYNRG-227ENST00000619976 LAMC1P11047 1609 aa40.68■■■■■ 4.1
SYNRG-227ENST00000619976 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.67■■■■■ 4.1
SYNRG-227ENST00000619976 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
SYNRG-227ENST00000619976 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.65■■■■■ 4.1
SYNRG-227ENST00000619976 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.63■■■■■ 4.1
SYNRG-227ENST00000619976 NHSL1Q5SYE7 1610 aa40.62■■■■■ 4.09
SYNRG-227ENST00000619976 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.61■■■■■ 4.09
SYNRG-227ENST00000619976 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.61■■■■■ 4.09
SYNRG-227ENST00000619976 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
SYNRG-227ENST00000619976 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.59■■■■■ 4.09
SYNRG-227ENST00000619976 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms