RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593438.1

HOXA-AS2-211, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXA-AS2, Length 629 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.8■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIF1BO60333 1816 aa21.79■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RGL3Q3MIN7 710 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MED14O60244 1454 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZFYVE9O95405 1425 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IQGAP1P46940 1657 aa21.73■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.7■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.69■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.68■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.67■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.65■■□□□ 1.06
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TBX22Q9Y458 520 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PPLO60437 1756 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NEUROD1Q13562 356 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.59■■□□□ 1.05
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CERKQ8TCT0 537 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.57■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.56■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KCNA6P17658 529 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 DIP2AQ14689 1571 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IFT172Q9UG01 1749 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CPS1P31327 1500 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 METP08581 1390 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PIK3R4Q99570 1358 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ALKQ9UM73 1620 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MYOM2P54296 1465 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STAC3Q96MF2 364 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PIK3C2GO75747 1445 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.45■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PTPRUQ92729 1446 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NWD1Q149M9 1564 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TMEM94Q12767 1356 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 STK26Q9P289 416 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TONSLQ96HA7 1378 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C14orf37Q86TY3 774 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 FBXO41Q8TF61 875 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LAMC1P11047 1609 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXA-AS2-211ENST00000593438 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TOM1O60784 492 aa21.32■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.32■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 MSH6P52701 1360 aa21.32■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.32■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ABCC11Q96J66 1382 aa21.3■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PIP4K2BP78356 416 aa21.29■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.29■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PTCH1Q13635 1447 aa21.29■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.29■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.28■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.28■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.28■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ATF3P18847 181 aa21.27■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TECPR2O15040 1411 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGRB1O14514 1584 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 POGKQ9P215 609 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PRAM1Q96QH2 718 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 SIRT1Q96EB6 747 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.22■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.21■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-211ENST00000593438 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms