RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592826.1

APBA3-208, Transcript of amyloid beta precursor protein binding family A member 3, human

TSL 2

Gene APBA3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APBA3-208	ENST00000592826	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.36	■■■□□ 2.93
APBA3-208	ENST00000592826	TRPM2	O94759	1503 aa		33.32	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.31	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	LTK	P29376	864 aa		33.31	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.31	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.3	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.28	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	33.27	■■■□□ 2.92
APBA3-208	ENST00000592826	HSPA1L	P34931	641 aa		33.24	■■■□□ 2.91
APBA3-208	ENST00000592826	ZFYVE9	O95405	1425 aa		33.22	■■■□□ 2.91
APBA3-208	ENST00000592826	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		33.21	■■■□□ 2.91
APBA3-208	ENST00000592826	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.18	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.18	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	FOXD1	Q16676	465 aa		33.18	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.15	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		33.14	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	KIF1B	O60333	1816 aa		33.14	■■■□□ 2.9
APBA3-208	ENST00000592826	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.13	■■■□□ 2.89
APBA3-208	ENST00000592826	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.12	■■■□□ 2.89
APBA3-208	ENST00000592826	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.1	■■■□□ 2.89
APBA3-208	ENST00000592826	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
APBA3-208	ENST00000592826	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.1	■■■□□ 2.89
APBA3-208	ENST00000592826	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		33.09	■■■□□ 2.89
APBA3-208	ENST00000592826	TBX22	Q9Y458	520 aa		33.03	■■■□□ 2.88
APBA3-208	ENST00000592826	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	33.02	■■■□□ 2.88
APBA3-208	ENST00000592826	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.02	■■■□□ 2.88
APBA3-208	ENST00000592826	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
APBA3-208	ENST00000592826	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.98	■■■□□ 2.87
APBA3-208	ENST00000592826	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.98	■■■□□ 2.87
APBA3-208	ENST00000592826	KCNA6	P17658	529 aa		32.96	■■■□□ 2.87
APBA3-208	ENST00000592826	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.96	■■■□□ 2.87
APBA3-208	ENST00000592826	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.95	■■■□□ 2.87
APBA3-208	ENST00000592826	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.94	■■■□□ 2.86
APBA3-208	ENST00000592826	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.93	■■■□□ 2.86
APBA3-208	ENST00000592826	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.92	■■■□□ 2.86
APBA3-208	ENST00000592826	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
APBA3-208	ENST00000592826	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.9	■■■□□ 2.86
APBA3-208	ENST00000592826	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
APBA3-208	ENST00000592826	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
APBA3-208	ENST00000592826	PPL	O60437	1756 aa		32.85	■■■□□ 2.85
APBA3-208	ENST00000592826	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.83	■■■□□ 2.85
APBA3-208	ENST00000592826	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
APBA3-208	ENST00000592826	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
APBA3-208	ENST00000592826	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.81	■■■□□ 2.84
APBA3-208	ENST00000592826	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
APBA3-208	ENST00000592826	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.79	■■■□□ 2.84
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.77	■■■□□ 2.84
APBA3-208	ENST00000592826	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.77	■■■□□ 2.84
APBA3-208	ENST00000592826	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.75	■■■□□ 2.83
APBA3-208	ENST00000592826	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.74	■■■□□ 2.83
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.74	■■■□□ 2.83
APBA3-208	ENST00000592826	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.73	■■■□□ 2.83
APBA3-208	ENST00000592826	MET	P08581	1390 aa		32.71	■■■□□ 2.83
APBA3-208	ENST00000592826	MYOM2	P54296	1465 aa		32.7	■■■□□ 2.83
APBA3-208	ENST00000592826	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.68	■■■□□ 2.82
APBA3-208	ENST00000592826	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.67	■■■□□ 2.82
APBA3-208	ENST00000592826	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
APBA3-208	ENST00000592826	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.65	■■■□□ 2.82
APBA3-208	ENST00000592826	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.63	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.62	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	MSH6	P52701	1360 aa		32.61	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.59	■■■□□ 2.81
APBA3-208	ENST00000592826	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.57	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.56	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.56	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.55	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.54	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	LAMC1	P11047	1609 aa		32.54	■■■□□ 2.8
APBA3-208	ENST00000592826	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.51	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		32.5	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.5	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.49	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.48	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	TECPR2	O15040	1411 aa		32.47	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	ATF3	P18847	181 aa		32.47	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.47	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	DCC	P43146	1447 aa		32.46	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	SIRT1	Q96EB6	747 aa		32.46	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.45	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.45	■■■□□ 2.79
APBA3-208	ENST00000592826	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.44	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	STK26	Q9P289	416 aa		32.42	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.41	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.41	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.41	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.4	■■■□□ 2.78
APBA3-208	ENST00000592826	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.38	■■■□□ 2.77
APBA3-208	ENST00000592826	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.36	■■■□□ 2.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms