RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591914.5

SMAD4-213, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 992 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-213	ENST00000591914	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		40.79	■■■■■ 4.12
SMAD4-213	ENST00000591914	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SMAD4-213	ENST00000591914	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.76	■■■■■ 4.12
SMAD4-213	ENST00000591914	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.76	■■■■■ 4.12
SMAD4-213	ENST00000591914	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		40.75	■■■■■ 4.11
SMAD4-213	ENST00000591914	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
SMAD4-213	ENST00000591914	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.72	■■■■■ 4.11
SMAD4-213	ENST00000591914	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.72	■■■■■ 4.11
SMAD4-213	ENST00000591914	BCAN	Q96GW7	911 aa		40.68	■■■■■ 4.1
SMAD4-213	ENST00000591914	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
SMAD4-213	ENST00000591914	KCNA6	P17658	529 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SMAD4-213	ENST00000591914	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
SMAD4-213	ENST00000591914	KIF1B	O60333	1816 aa		40.63	■■■■■ 4.1
SMAD4-213	ENST00000591914	NWD1	Q149M9	1564 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.61	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	TOM1	O60784	492 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	FOXD1	Q16676	465 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	40.58	■■■■■ 4.09
SMAD4-213	ENST00000591914	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.57	■■■■■ 4.08
SMAD4-213	ENST00000591914	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SMAD4-213	ENST00000591914	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SMAD4-213	ENST00000591914	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
SMAD4-213	ENST00000591914	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.54	■■■■■ 4.08
SMAD4-213	ENST00000591914	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.5	■■■■■ 4.07
SMAD4-213	ENST00000591914	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SMAD4-213	ENST00000591914	TMEM94	Q12767	1356 aa		40.48	■■■■■ 4.07
SMAD4-213	ENST00000591914	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.48	■■■■■ 4.07
SMAD4-213	ENST00000591914	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SMAD4-213	ENST00000591914	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
SMAD4-213	ENST00000591914	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SMAD4-213	ENST00000591914	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
SMAD4-213	ENST00000591914	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		40.4	■■■■■ 4.06
SMAD4-213	ENST00000591914	HRC	P23327	699 aa		40.36	■■■■■ 4.05
SMAD4-213	ENST00000591914	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	40.36	■■■■■ 4.05
SMAD4-213	ENST00000591914	PPL	O60437	1756 aa		40.35	■■■■■ 4.05
SMAD4-213	ENST00000591914	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SMAD4-213	ENST00000591914	PTPRU	Q92729	1446 aa		40.34	■■■■■ 4.05
SMAD4-213	ENST00000591914	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
SMAD4-213	ENST00000591914	MET	P08581	1390 aa		40.29	■■■■■ 4.04
SMAD4-213	ENST00000591914	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	40.28	■■■■■ 4.04
SMAD4-213	ENST00000591914	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SMAD4-213	ENST00000591914	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		40.28	■■■■■ 4.04
SMAD4-213	ENST00000591914	HSPA1L	P34931	641 aa		40.26	■■■■■ 4.04
SMAD4-213	ENST00000591914	MSH6	P52701	1360 aa		40.25	■■■■■ 4.03
SMAD4-213	ENST00000591914	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
SMAD4-213	ENST00000591914	IFT172	Q9UG01	1749 aa		40.22	■■■■■ 4.03
SMAD4-213	ENST00000591914	RGL3	Q3MIN7	710 aa		40.21	■■■■■ 4.03
SMAD4-213	ENST00000591914	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		40.18	■■■■■ 4.02
SMAD4-213	ENST00000591914	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		40.16	■■■■■ 4.02
SMAD4-213	ENST00000591914	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		40.13	■■■■■ 4.01
SMAD4-213	ENST00000591914	C14orf37	Q86TY3	774 aa		40.11	■■■■■ 4.01
SMAD4-213	ENST00000591914	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
SMAD4-213	ENST00000591914	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		40.1	■■■■■ 4.01
SMAD4-213	ENST00000591914	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		40.08	■■■■■ 4.01
SMAD4-213	ENST00000591914	SLAIN2	Q9P270	581 aa		40.07	■■■■■ 4.01
SMAD4-213	ENST00000591914	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		40.06	■■■■■ 4
SMAD4-213	ENST00000591914	PIK3C2G	O75747	1445 aa		40.04	■■■■■ 4
SMAD4-213	ENST00000591914	PTCH1	Q13635	1447 aa		40.03	■■■■■ 4
SMAD4-213	ENST00000591914	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.02	■■■■■ 4
SMAD4-213	ENST00000591914	DCC	P43146	1447 aa		40.01	■■■■■ 4
SMAD4-213	ENST00000591914	MYOM2	P54296	1465 aa		40	■■■■□ 3.99
SMAD4-213	ENST00000591914	ATF3	P18847	181 aa		39.99	■■■■□ 3.99
SMAD4-213	ENST00000591914	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		39.99	■■■■□ 3.99
SMAD4-213	ENST00000591914	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		39.97	■■■■□ 3.99
SMAD4-213	ENST00000591914	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		39.96	■■■■□ 3.99
SMAD4-213	ENST00000591914	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		39.95	■■■■□ 3.99
SMAD4-213	ENST00000591914	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		39.94	■■■■□ 3.98
SMAD4-213	ENST00000591914	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		39.92	■■■■□ 3.98
SMAD4-213	ENST00000591914	TECPR2	O15040	1411 aa		39.87	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	LAMC1	P11047	1609 aa		39.87	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	39.86	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	39.86	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	39.85	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	MST1R	Q04912	1400 aa		39.84	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		39.82	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		39.82	■■■■□ 3.97
SMAD4-213	ENST00000591914	ABCC11	Q96J66	1382 aa		39.82	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	PHLPP1	O60346	1717 aa		39.82	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	39.79	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		39.78	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	STK26	Q9P289	416 aa		39.78	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	BRINP3	Q76B58	766 aa		39.77	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		39.77	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	39.76	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	39.76	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	STAC3	Q96MF2	364 aa		39.76	■■■■□ 3.96
SMAD4-213	ENST00000591914	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	39.75	■■■■□ 3.95
SMAD4-213	ENST00000591914	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		39.71	■■■■□ 3.95
SMAD4-213	ENST00000591914	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		39.69	■■■■□ 3.94
SMAD4-213	ENST00000591914	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		39.69	■■■■□ 3.94
SMAD4-213	ENST00000591914	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		39.68	■■■■□ 3.94
SMAD4-213	ENST00000591914	SIRT1	Q96EB6	747 aa		39.67	■■■■□ 3.94
SMAD4-213	ENST00000591914	ADGRB1	O14514	1584 aa		39.67	■■■■□ 3.94
SMAD4-213	ENST00000591914	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		39.66	■■■■□ 3.94
SMAD4-213	ENST00000591914	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	39.64	■■■■□ 3.94

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