RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590954.5

TXNL1-211, Transcript of thioredoxin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TXNL1, Length 1,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNL1-211ENST00000590954 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
TXNL1-211ENST00000590954 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.16■■■□□ 2.26
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TXNL1-211ENST00000590954 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
TXNL1-211ENST00000590954 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
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TXNL1-211ENST00000590954 TOM1O60784 492 aa29.14■■■□□ 2.25
TXNL1-211ENST00000590954 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
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TXNL1-211ENST00000590954 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
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TXNL1-211ENST00000590954 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.91■■■□□ 2.22
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TXNL1-211ENST00000590954 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.88■■■□□ 2.21
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TXNL1-211ENST00000590954 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.87■■■□□ 2.21
TXNL1-211ENST00000590954 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.86■■■□□ 2.21
TXNL1-211ENST00000590954 C14orf37Q86TY3 774 aa28.84■■■□□ 2.21
TXNL1-211ENST00000590954 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.84■■■□□ 2.21
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TXNL1-211ENST00000590954 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.74■■■□□ 2.19
TXNL1-211ENST00000590954 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.72■■■□□ 2.19
TXNL1-211ENST00000590954 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.7■■■□□ 2.19
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TXNL1-211ENST00000590954 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.68■■■□□ 2.18
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TXNL1-211ENST00000590954 PTCH1Q13635 1447 aa28.6■■■□□ 2.17
TXNL1-211ENST00000590954 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.59■■■□□ 2.17
TXNL1-211ENST00000590954 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.58■■■□□ 2.17
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TXNL1-211ENST00000590954 PIK3C2GO75747 1445 aa28.53■■■□□ 2.16
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TXNL1-211ENST00000590954 STK26Q9P289 416 aa28.45■■■□□ 2.15
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TXNL1-211ENST00000590954 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.34■■■□□ 2.13
TXNL1-211ENST00000590954 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TXNL1-211ENST00000590954 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.34■■■□□ 2.13
TXNL1-211ENST00000590954 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.33■■■□□ 2.13
TXNL1-211ENST00000590954 SHPRHQ149N8 1683 aa28.3■■■□□ 2.12
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