RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590198.1

ROGDI-212, Transcript of rogdi homolog, humanhuman

TSL 3

Gene ROGDI, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROGDI-212ENST00000590198 ZFYVE9O95405 1425 aa45.17■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 IQGAP1P46940 1657 aa45.15■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP45.14■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 KIF1BO60333 1816 aa45.14■■■■■ 4.82
ROGDI-212ENST00000590198 BCANQ96GW7 911 aa45.09■■■■■ 4.81
ROGDI-212ENST00000590198 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
ROGDI-212ENST00000590198 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
ROGDI-212ENST00000590198 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa45.04■■■■■ 4.8
ROGDI-212ENST00000590198 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa45.01■■■■■ 4.8
ROGDI-212ENST00000590198 SLC26A8Q96RN1 970 aa44.98■■■■■ 4.79
ROGDI-212ENST00000590198 RGL3Q3MIN7 710 aa44.97■■■■■ 4.79
ROGDI-212ENST00000590198 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa44.94■■■■■ 4.78
ROGDI-212ENST00000590198 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa44.94■■■■■ 4.78
ROGDI-212ENST00000590198 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.93■■■■■ 4.78
ROGDI-212ENST00000590198 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa44.92■■■■■ 4.78
ROGDI-212ENST00000590198 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.91■■■■■ 4.78
ROGDI-212ENST00000590198 CERKQ8TCT0 537 aa44.9■■■■■ 4.78
ROGDI-212ENST00000590198 VGFO15240 615 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
ROGDI-212ENST00000590198 TBX22Q9Y458 520 aa44.82■■■■■ 4.77
ROGDI-212ENST00000590198 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa44.8■■■■■ 4.76
ROGDI-212ENST00000590198 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
ROGDI-212ENST00000590198 PPLO60437 1756 aa44.78■■■■■ 4.76
ROGDI-212ENST00000590198 CPS1P31327 1500 aa44.75■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 KCNA6P17658 529 aa44.73■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa44.73■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 STRCP1A6NGW2 1772 aa44.72■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 DIP2AQ14689 1571 aa44.71■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa44.7■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa44.7■■■■■ 4.75
ROGDI-212ENST00000590198 IFT172Q9UG01 1749 aa44.66■■■■■ 4.74
ROGDI-212ENST00000590198 PIK3R4Q99570 1358 aa44.61■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 SIN3AQ96ST3 1273 aa44.59■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 LRRC7Q96NW7 1537 aa44.59■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.59■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 METP08581 1390 aa44.57■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 DCAF11Q8TEB1 546 aa44.57■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa44.57■■■■■ 4.73
ROGDI-212ENST00000590198 NWD1Q149M9 1564 aa44.56■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP44.55■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 ALKQ9UM73 1620 aa44.54■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa44.54■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 PTPRUQ92729 1446 aa44.53■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 NEUROD1Q13562 356 aa44.53■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 MYOM2P54296 1465 aa44.53■■■■■ 4.72
ROGDI-212ENST00000590198 FBXO41Q8TF61 875 aa44.5■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 PIK3C2GO75747 1445 aa44.5■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 NRXN1Q9ULB1 1477 aa44.46■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 TMEM94Q12767 1356 aa44.45■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 STAC3Q96MF2 364 aa44.45■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.71
ROGDI-212ENST00000590198 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.39■■■■■ 4.7
ROGDI-212ENST00000590198 CFAP70Q5T0N1 1121 aa44.39■■■■■ 4.7
ROGDI-212ENST00000590198 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
ROGDI-212ENST00000590198 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
ROGDI-212ENST00000590198 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
ROGDI-212ENST00000590198 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
ROGDI-212ENST00000590198 TMEM132EQ6IEE7 984 aa44.35■■■■■ 4.69
ROGDI-212ENST00000590198 L3MBTL2Q969R5 705 aa44.34■■■■■ 4.69
ROGDI-212ENST00000590198 TOM1O60784 492 aa44.3■■■■■ 4.68
ROGDI-212ENST00000590198 C14orf37Q86TY3 774 aa44.3■■■■■ 4.68
ROGDI-212ENST00000590198 STK26Q9P289 416 aa44.29■■■■■ 4.68
ROGDI-212ENST00000590198 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa44.26■■■■■ 4.68
ROGDI-212ENST00000590198 LAMC1P11047 1609 aa44.26■■■■■ 4.68
ROGDI-212ENST00000590198 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa44.24■■■■■ 4.67
ROGDI-212ENST00000590198 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
ROGDI-212ENST00000590198 MSH6P52701 1360 aa44.23■■■■■ 4.67
ROGDI-212ENST00000590198 ROBO2Q9HCK4 1378 aa44.21■■■■■ 4.67
ROGDI-212ENST00000590198 PTCH1Q13635 1447 aa44.2■■■■■ 4.67
ROGDI-212ENST00000590198 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 PIP4K2BP78356 416 aa44.19■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP44.18■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 TONSLQ96HA7 1378 aa44.17■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 ABCC11Q96J66 1382 aa44.17■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 PRAG1Q86YV5 1406 aa44.16■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 C19orf44Q9H6X5 657 aa44.15■■■■■ 4.66
ROGDI-212ENST00000590198 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
ROGDI-212ENST00000590198 TECPR2O15040 1411 aa44.11■■■■■ 4.65
ROGDI-212ENST00000590198 ADGRB1O14514 1584 aa44.1■■■■■ 4.65
ROGDI-212ENST00000590198 CLSPNQ9HAW4 1339 aa44.08■■■■■ 4.65
ROGDI-212ENST00000590198 WAPLQ7Z5K2 1190 aa44.08■■■■■ 4.65
ROGDI-212ENST00000590198 ATF3P18847 181 aa44.07■■■■■ 4.65
ROGDI-212ENST00000590198 KNDC1Q76NI1 1749 aa44.06■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 CADPS2Q86UW7 1296 aa44.04■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa44.04■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 SIRT1Q96EB6 747 aa44.03■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 TRAK1Q9UPV9 953 aa44.03■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 NBPF1Q3BBV0 1214 aa44.02■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa44.01■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa44.01■■■■■ 4.64
ROGDI-212ENST00000590198 SLAIN2Q9P270 581 aa44■■■■■ 4.63
ROGDI-212ENST00000590198 FAM135BQ49AJ0 1406 aa43.99■■■■■ 4.63
ROGDI-212ENST00000590198 NALCNQ8IZF0 1738 aa43.98■■■■■ 4.63
ROGDI-212ENST00000590198 PRAM1Q96QH2 718 aa43.96■■■■■ 4.63
ROGDI-212ENST00000590198 DCCP43146 1447 aa43.96■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms