RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.79■■■□□ 2.36
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.74■■■□□ 2.35
EFTUD2-217ENST00000590124 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
EFTUD2-217ENST00000590124 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF1BO60333 1816 aa29.69■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.69■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.69■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.69■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.68■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 FOXD1Q16676 465 aa29.65■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
EFTUD2-217ENST00000590124 NWD1Q149M9 1564 aa29.63■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.62■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 BCANQ96GW7 911 aa29.62■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.62■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 KCNA6P17658 529 aa29.61■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.6■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 DIP2AQ14689 1571 aa29.6■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 TBX22Q9Y458 520 aa29.59■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
EFTUD2-217ENST00000590124 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.57■■■□□ 2.32
EFTUD2-217ENST00000590124 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.56■■■□□ 2.32
EFTUD2-217ENST00000590124 ALKQ9UM73 1620 aa29.56■■■□□ 2.32
EFTUD2-217ENST00000590124 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
EFTUD2-217ENST00000590124 HRCP23327 699 aa29.54■■■□□ 2.32
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.53■■■□□ 2.32
EFTUD2-217ENST00000590124 PIK3R4Q99570 1358 aa29.51■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 TOM1O60784 492 aa29.5■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 PPLO60437 1756 aa29.49■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM94Q12767 1356 aa29.49■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.48■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.48■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
EFTUD2-217ENST00000590124 PTPRUQ92729 1446 aa29.44■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 IFT172Q9UG01 1749 aa29.41■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 METP08581 1390 aa29.39■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 PIP4K2BP78356 416 aa29.39■■■□□ 2.3
EFTUD2-217ENST00000590124 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.38■■■□□ 2.29
EFTUD2-217ENST00000590124 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.37■■■□□ 2.29
EFTUD2-217ENST00000590124 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.36■■■□□ 2.29
EFTUD2-217ENST00000590124 RGL3Q3MIN7 710 aa29.35■■■□□ 2.29
EFTUD2-217ENST00000590124 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
EFTUD2-217ENST00000590124 MSH6P52701 1360 aa29.3■■■□□ 2.28
EFTUD2-217ENST00000590124 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.3■■■□□ 2.28
EFTUD2-217ENST00000590124 HSPA1LP34931 641 aa29.27■■■□□ 2.28
EFTUD2-217ENST00000590124 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
EFTUD2-217ENST00000590124 PIK3C2GO75747 1445 aa29.24■■■□□ 2.27
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.24■■■□□ 2.27
EFTUD2-217ENST00000590124 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.24■■■□□ 2.27
EFTUD2-217ENST00000590124 MYOM2P54296 1465 aa29.23■■■□□ 2.27
EFTUD2-217ENST00000590124 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.22■■■□□ 2.27
EFTUD2-217ENST00000590124 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.2■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 PTCH1Q13635 1447 aa29.2■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.19■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 C14orf37Q86TY3 774 aa29.19■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.17■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 SLAIN2Q9P270 581 aa29.17■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 DCCP43146 1447 aa29.16■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.15■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.15■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.14■■■□□ 2.26
EFTUD2-217ENST00000590124 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.13■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 LAMC1P11047 1609 aa29.12■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 ATF3P18847 181 aa29.11■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 TECPR2O15040 1411 aa29.1■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.09■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
EFTUD2-217ENST00000590124 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.07■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC11Q96J66 1382 aa29.06■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 MST1RQ04912 1400 aa29.05■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.05■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.05■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 STAC3Q96MF2 364 aa29.04■■■□□ 2.24
EFTUD2-217ENST00000590124 STK26Q9P289 416 aa29.01■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 PHLPP1O60346 1717 aa29■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 ADGRB1O14514 1584 aa29■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 BRINP3Q76B58 766 aa28.97■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.97■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.96■■■□□ 2.23
EFTUD2-217ENST00000590124 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.95■■■□□ 2.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SIRT1Q96EB6 747 aa28.95■■■□□ 2.22
EFTUD2-217ENST00000590124 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.95■■■□□ 2.22
EFTUD2-217ENST00000590124 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms