RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	29.93	■■■□□ 2.38
PSME3-209	ENST00000589469	TRPM2	O94759	1503 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PSME3-209	ENST00000589469	CPS1	P31327	1500 aa		29.91	■■■□□ 2.38
PSME3-209	ENST00000589469	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.9	■■■□□ 2.38
PSME3-209	ENST00000589469	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	29.88	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		29.87	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	CLTCL1	P53675	1640 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		29.84	■■■□□ 2.37
PSME3-209	ENST00000589469	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.82	■■■□□ 2.36
PSME3-209	ENST00000589469	FOXD1	Q16676	465 aa		29.81	■■■□□ 2.36
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PSME3-209	ENST00000589469	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
PSME3-209	ENST00000589469	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
PSME3-209	ENST00000589469	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PSME3-209	ENST00000589469	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PSME3-209	ENST00000589469	KCNA6	P17658	529 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PSME3-209	ENST00000589469	TBX22	Q9Y458	520 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PSME3-209	ENST00000589469	KIF1B	O60333	1816 aa		29.7	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	HRC	P23327	699 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	DIP2A	Q14689	1571 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	NWD1	Q149M9	1564 aa		29.65	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		29.64	■■■□□ 2.34
PSME3-209	ENST00000589469	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	TOM1	O60784	492 aa		29.63	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		29.62	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	PIK3R4	Q99570	1358 aa		29.61	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	29.6	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.59	■■■□□ 2.33
PSME3-209	ENST00000589469	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		29.57	■■■□□ 2.32
PSME3-209	ENST00000589469	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		29.56	■■■□□ 2.32
PSME3-209	ENST00000589469	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
PSME3-209	ENST00000589469	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.54	■■■□□ 2.32
PSME3-209	ENST00000589469	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
PSME3-209	ENST00000589469	RGL3	Q3MIN7	710 aa		29.53	■■■□□ 2.32
PSME3-209	ENST00000589469	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	29.51	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	29.5	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	PTPRU	Q92729	1446 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	MET	P08581	1390 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	PPL	O60437	1756 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	MSH6	P52701	1360 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PSME3-209	ENST00000589469	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PSME3-209	ENST00000589469	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PSME3-209	ENST00000589469	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
PSME3-209	ENST00000589469	C14orf37	Q86TY3	774 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PSME3-209	ENST00000589469	IFT172	Q9UG01	1749 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PSME3-209	ENST00000589469	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
PSME3-209	ENST00000589469	HSPA1L	P34931	641 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PSME3-209	ENST00000589469	PIK3C2G	O75747	1445 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
PSME3-209	ENST00000589469	MYOM2	P54296	1465 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PSME3-209	ENST00000589469	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	PTCH1	Q13635	1447 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	ATF3	P18847	181 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	SLAIN2	Q9P270	581 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PSME3-209	ENST00000589469	DCC	P43146	1447 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	STAC3	Q96MF2	364 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	STK26	Q9P289	416 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	LAMC1	P11047	1609 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	TECPR2	O15040	1411 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	ABCC11	Q96J66	1382 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PSME3-209	ENST00000589469	MST1R	Q04912	1400 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PSME3-209	ENST00000589469	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PSME3-209	ENST00000589469	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PSME3-209	ENST00000589469	BRINP3	Q76B58	766 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	SIRT1	Q96EB6	747 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	ADGRB1	O14514	1584 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PSME3-209	ENST00000589469	PHLPP1	O60346	1717 aa		29.02	■■■□□ 2.24

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