RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588315.5

SLC25A39-210, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A39, Length 1,409 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-210ENST00000588315 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.07■■■□□ 2.4
SLC25A39-210ENST00000588315 ZFYVE9O95405 1425 aa30.06■■■□□ 2.4
SLC25A39-210ENST00000588315 FOXD1Q16676 465 aa30.05■■■□□ 2.4
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC25A39-210ENST00000588315 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC25A39-210ENST00000588315 CPS1P31327 1500 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC25A39-210ENST00000588315 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SLC25A39-210ENST00000588315 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.01■■■□□ 2.39
SLC25A39-210ENST00000588315 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30■■■□□ 2.39
SLC25A39-210ENST00000588315 PCGF6Q9BYE7 350 aa30■■■□□ 2.39
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF1BO60333 1816 aa29.97■■■□□ 2.39
SLC25A39-210ENST00000588315 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.95■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.92■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.91■■■□□ 2.38
SLC25A39-210ENST00000588315 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.87■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.84■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 BCANQ96GW7 911 aa29.83■■■□□ 2.37
SLC25A39-210ENST00000588315 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 KCNA6P17658 529 aa29.82■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 ALKQ9UM73 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 TBX22Q9Y458 520 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 NWD1Q149M9 1564 aa29.78■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 PPLO60437 1756 aa29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SLC25A39-210ENST00000588315 IFT172Q9UG01 1749 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.74■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 TMEM94Q12767 1356 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 TOM1O60784 492 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 DIP2AQ14689 1571 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SLC25A39-210ENST00000588315 MYOM2P54296 1465 aa29.7■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 PIP4K2BP78356 416 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 RGL3Q3MIN7 710 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 PTPRUQ92729 1446 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 PIK3R4Q99570 1358 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.65■■■□□ 2.34
SLC25A39-210ENST00000588315 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.63■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 STAC3Q96MF2 364 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 METP08581 1390 aa29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 PIK3C2GO75747 1445 aa29.6■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.59■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.58■■■□□ 2.33
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.57■■■□□ 2.32
SLC25A39-210ENST00000588315 HSPA1LP34931 641 aa29.56■■■□□ 2.32
SLC25A39-210ENST00000588315 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
SLC25A39-210ENST00000588315 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SLC25A39-210ENST00000588315 LAMC1P11047 1609 aa29.52■■■□□ 2.32
SLC25A39-210ENST00000588315 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.51■■■□□ 2.31
SLC25A39-210ENST00000588315 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.5■■■□□ 2.31
SLC25A39-210ENST00000588315 MSH6P52701 1360 aa29.49■■■□□ 2.31
SLC25A39-210ENST00000588315 NEUROD1Q13562 356 aa29.48■■■□□ 2.31
SLC25A39-210ENST00000588315 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.47■■■□□ 2.31
SLC25A39-210ENST00000588315 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.45■■■□□ 2.31
SLC25A39-210ENST00000588315 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.44■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 TONSLQ96HA7 1378 aa29.42■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 C14orf37Q86TY3 774 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 SLAIN2Q9P270 581 aa29.4■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.39■■■□□ 2.3
SLC25A39-210ENST00000588315 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.38■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGRB1O14514 1584 aa29.37■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 TECPR2O15040 1411 aa29.36■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 PTCH1Q13635 1447 aa29.36■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.35■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.34■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.33■■■□□ 2.29
SLC25A39-210ENST00000588315 DCCP43146 1447 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.31■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC11Q96J66 1382 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 ATF3P18847 181 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.3■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-210ENST00000588315 DLC1Q96QB1 1528 aa29.26■■■□□ 2.27
SLC25A39-210ENST00000588315 MST1RQ04912 1400 aa29.25■■■□□ 2.27
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