RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.9■□□□□ 0.14
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CTIF-204ENST00000587769 EID1Q9Y6B2 187 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-204ENST00000587769 CPS1P31327 1500 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-204ENST00000587769 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.87■□□□□ 0.13
CTIF-204ENST00000587769 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.86■□□□□ 0.13
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CTIF-204ENST00000587769 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP15.71■□□□□ 0.11
CTIF-204ENST00000587769 TONSLQ96HA7 1378 aa15.71■□□□□ 0.11
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CTIF-204ENST00000587769 PIK3R4Q99570 1358 aa15.59■□□□□ 0.09
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CTIF-204ENST00000587769 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
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CTIF-204ENST00000587769 C19orf44Q9H6X5 657 aa15.52■□□□□ 0.08
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CTIF-204ENST00000587769 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.48■□□□□ 0.07
CTIF-204ENST00000587769 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTIF-204ENST00000587769 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.47■□□□□ 0.07
CTIF-204ENST00000587769 TECPR2O15040 1411 aa15.45■□□□□ 0.06
CTIF-204ENST00000587769 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTIF-204ENST00000587769 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTIF-204ENST00000587769 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTIF-204ENST00000587769 PTCH1Q13635 1447 aa15.44■□□□□ 0.06
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