RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	HRC	P23327	699 aa		32.64	■■■□□ 2.82
GPS1-222	ENST00000583983	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
GPS1-222	ENST00000583983	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.59	■■■□□ 2.81
GPS1-222	ENST00000583983	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
GPS1-222	ENST00000583983	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.56	■■■□□ 2.8
GPS1-222	ENST00000583983	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
GPS1-222	ENST00000583983	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-222	ENST00000583983	KIF1B	O60333	1816 aa		32.53	■■■□□ 2.8
GPS1-222	ENST00000583983	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GPS1-222	ENST00000583983	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	CPS1	P31327	1500 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.5	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.48	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GPS1-222	ENST00000583983	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.44	■■■□□ 2.78
GPS1-222	ENST00000583983	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-222	ENST00000583983	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.41	■■■□□ 2.78
GPS1-222	ENST00000583983	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.4	■■■□□ 2.78
GPS1-222	ENST00000583983	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	KCNA6	P17658	529 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GPS1-222	ENST00000583983	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GPS1-222	ENST00000583983	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.31	■■■□□ 2.76
GPS1-222	ENST00000583983	PPL	O60437	1756 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GPS1-222	ENST00000583983	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GPS1-222	ENST00000583983	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
GPS1-222	ENST00000583983	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	MET	P08581	1390 aa		32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.2	■■■□□ 2.75
GPS1-222	ENST00000583983	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.2	■■■□□ 2.74
GPS1-222	ENST00000583983	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
GPS1-222	ENST00000583983	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.18	■■■□□ 2.74
GPS1-222	ENST00000583983	TOM1	O60784	492 aa		32.17	■■■□□ 2.74
GPS1-222	ENST00000583983	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
GPS1-222	ENST00000583983	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GPS1-222	ENST00000583983	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.12	■■■□□ 2.73
GPS1-222	ENST00000583983	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
GPS1-222	ENST00000583983	MYOM2	P54296	1465 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-222	ENST00000583983	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.09	■■■□□ 2.73
GPS1-222	ENST00000583983	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-222	ENST00000583983	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.07	■■■□□ 2.72
GPS1-222	ENST00000583983	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.06	■■■□□ 2.72
GPS1-222	ENST00000583983	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
GPS1-222	ENST00000583983	MSH6	P52701	1360 aa		32.03	■■■□□ 2.72
GPS1-222	ENST00000583983	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
GPS1-222	ENST00000583983	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.98	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.95	■■■□□ 2.71
GPS1-222	ENST00000583983	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.94	■■■□□ 2.7
GPS1-222	ENST00000583983	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-222	ENST00000583983	LAMC1	P11047	1609 aa		31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-222	ENST00000583983	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
GPS1-222	ENST00000583983	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-222	ENST00000583983	STK26	Q9P289	416 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GPS1-222	ENST00000583983	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	TECPR2	O15040	1411 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	ATF3	P18847	181 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	HSPA1L	P34931	641 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.87	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	DCC	P43146	1447 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	NEUROD1	Q13562	356 aa		31.85	■■■□□ 2.69
GPS1-222	ENST00000583983	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.82	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.81	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		31.8	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.78	■■■□□ 2.68
GPS1-222	ENST00000583983	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.75	■■■□□ 2.67
GPS1-222	ENST00000583983	MST1R	Q04912	1400 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GPS1-222	ENST00000583983	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.7	■■■□□ 2.67
GPS1-222	ENST00000583983	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GPS1-222	ENST00000583983	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.68	■■■□□ 2.66
GPS1-222	ENST00000583983	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.68	■■■□□ 2.66

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