RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 VPS53Q5VIR6 699 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 RIPK4P57078 832 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 CEP89Q96ST8 783 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRM-211ENST00000580170 TEFQ10587 303 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF592Q92610 1267 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 PKNOX2Q96KN3 472 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 GPS2Q13227 327 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 NECTIN2Q92692 538 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 RUNDC1Q96C34 613 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC7Q96M83 1385 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 NGEFQ8N5V2 710 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 TPM1P09493 284 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 ROCK1Q13464 1354 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 TPM2P07951 284 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 CALRP27797 417 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
PTPRM-211ENST00000580170 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 TEX35Q5T0J7 233 aa26■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM29Q14134 588 aa26■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 BICD2Q8TD16 824 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 LNPKQ9C0E8 428 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 NUCB2P80303 420 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 RNF20Q5VTR2 975 aa25.95■■□□□ 1.75
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC70Q6NSX1 233 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 PANK1Q8TE04 598 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 CPLX1O14810 134 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 PTPRGP23470 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCA4P51532 1647 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 APPP05067 770 aa25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 NFKBIBQ15653 356 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 GNAI1P63096 354 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 CUX1P39880 1505 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 EVA1CP58658 441 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 HOMER1Q86YM7 354 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRM-211ENST00000580170 HMOX1P09601 288 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 FBXW7Q969H0 707 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 MAP7D2Q96T17 732 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 AAMPQ13685 434 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 FOSBP53539 338 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 TRDNQ13061 729 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 CDC45O75419 566 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 ERC2O15083 957 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 MIA2Q96PC5 1412 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 RAD21O60216 631 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRM-211ENST00000580170 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.83■■□□□ 1.72
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