RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574941.5

TRAP1-211, Transcript of TNF receptor associated protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene TRAP1, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAP1-211ENST00000574941 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
TRAP1-211ENST00000574941 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 BCANQ96GW7 911 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 CERKQ8TCT0 537 aa28.97■■■□□ 2.23
TRAP1-211ENST00000574941 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAP1-211ENST00000574941 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAP1-211ENST00000574941 KIF1BO60333 1816 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAP1-211ENST00000574941 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAP1-211ENST00000574941 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAP1-211ENST00000574941 RGL3Q3MIN7 710 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAP1-211ENST00000574941 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAP1-211ENST00000574941 CPS1P31327 1500 aa28.84■■■□□ 2.21
TRAP1-211ENST00000574941 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.83■■■□□ 2.21
TRAP1-211ENST00000574941 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.81■■■□□ 2.2
TRAP1-211ENST00000574941 TBX22Q9Y458 520 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAP1-211ENST00000574941 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.78■■■□□ 2.2
TRAP1-211ENST00000574941 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
TRAP1-211ENST00000574941 KCNA6P17658 529 aa28.77■■■□□ 2.2
TRAP1-211ENST00000574941 FBXO41Q8TF61 875 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 DIP2AQ14689 1571 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 PPLO60437 1756 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAP1-211ENST00000574941 NWD1Q149M9 1564 aa28.7■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.69■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 PIK3R4Q99570 1358 aa28.67■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 METP08581 1390 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 IFT172Q9UG01 1749 aa28.65■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.64■■■□□ 2.18
TRAP1-211ENST00000574941 TMEM94Q12767 1356 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 PTPRUQ92729 1446 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 ALKQ9UM73 1620 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 MYOM2P54296 1465 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 PIK3C2GO75747 1445 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAP1-211ENST00000574941 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 TOM1O60784 492 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAP1-211ENST00000574941 C14orf37Q86TY3 774 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 PIP4K2BP78356 416 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 NEUROD1Q13562 356 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 MSH6P52701 1360 aa28.48■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.47■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.45■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.45■■■□□ 2.15
TRAP1-211ENST00000574941 STAC3Q96MF2 364 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 STK26Q9P289 416 aa28.44■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.43■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 PTCH1Q13635 1447 aa28.43■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 LAMC1P11047 1609 aa28.41■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.4■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.39■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.39■■■□□ 2.14
TRAP1-211ENST00000574941 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 ABCC11Q96J66 1382 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 ATF3P18847 181 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 TECPR2O15040 1411 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAP1-211ENST00000574941 ADGRB1O14514 1584 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 SLAIN2Q9P270 581 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 DCCP43146 1447 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 HSPA1LP34931 641 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.26■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 TONSLQ96HA7 1378 aa28.26■■■□□ 2.12
TRAP1-211ENST00000574941 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.25■■■□□ 2.11
TRAP1-211ENST00000574941 SIRT1Q96EB6 747 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAP1-211ENST00000574941 PRAM1Q96QH2 718 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAP1-211ENST00000574941 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAP1-211ENST00000574941 MST1RQ04912 1400 aa28.21■■■□□ 2.11
TRAP1-211ENST00000574941 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
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