RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570125.5

CARHSP1-215, Transcript of calcium regulated heat stable protein 1, human

TSL 4

Gene CARHSP1, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CARHSP1-215	ENST00000570125	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CARHSP1-215	ENST00000570125	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
CARHSP1-215	ENST00000570125	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CARHSP1-215	ENST00000570125	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42.3	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
CARHSP1-215	ENST00000570125	FOXD1	Q16676	465 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CARHSP1-215	ENST00000570125	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CARHSP1-215	ENST00000570125	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CARHSP1-215	ENST00000570125	KIF1B	O60333	1816 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CARHSP1-215	ENST00000570125	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
CARHSP1-215	ENST00000570125	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CARHSP1-215	ENST00000570125	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CARHSP1-215	ENST00000570125	KCNA6	P17658	529 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CARHSP1-215	ENST00000570125	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CARHSP1-215	ENST00000570125	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.12	■■■■■ 4.33
CARHSP1-215	ENST00000570125	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CARHSP1-215	ENST00000570125	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CARHSP1-215	ENST00000570125	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.07	■■■■■ 4.33
CARHSP1-215	ENST00000570125	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.04	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	TOM1	O60784	492 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CARHSP1-215	ENST00000570125	HRC	P23327	699 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CARHSP1-215	ENST00000570125	TMEM94	Q12767	1356 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CARHSP1-215	ENST00000570125	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	41.96	■■■■■ 4.31
CARHSP1-215	ENST00000570125	PIK3R4	Q99570	1358 aa		41.96	■■■■■ 4.31
CARHSP1-215	ENST00000570125	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CARHSP1-215	ENST00000570125	PPL	O60437	1756 aa		41.93	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		41.93	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	PIP4K2B	P78356	416 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	41.91	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	41.9	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	41.89	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	PTPRU	Q92729	1446 aa		41.88	■■■■■ 4.3
CARHSP1-215	ENST00000570125	RGL3	Q3MIN7	710 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CARHSP1-215	ENST00000570125	MET	P08581	1390 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CARHSP1-215	ENST00000570125	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		41.82	■■■■■ 4.29
CARHSP1-215	ENST00000570125	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
CARHSP1-215	ENST00000570125	IFT172	Q9UG01	1749 aa		41.8	■■■■■ 4.28
CARHSP1-215	ENST00000570125	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		41.79	■■■■■ 4.28
CARHSP1-215	ENST00000570125	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
CARHSP1-215	ENST00000570125	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		41.74	■■■■■ 4.27
CARHSP1-215	ENST00000570125	MSH6	P52701	1360 aa		41.74	■■■■■ 4.27
CARHSP1-215	ENST00000570125	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		41.72	■■■■■ 4.27
CARHSP1-215	ENST00000570125	HSPA1L	P34931	641 aa		41.69	■■■■■ 4.26
CARHSP1-215	ENST00000570125	C14orf37	Q86TY3	774 aa		41.63	■■■■■ 4.25
CARHSP1-215	ENST00000570125	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	41.6	■■■■■ 4.25
CARHSP1-215	ENST00000570125	PIK3C2G	O75747	1445 aa		41.6	■■■■■ 4.25
CARHSP1-215	ENST00000570125	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		41.6	■■■■■ 4.25
CARHSP1-215	ENST00000570125	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		41.57	■■■■■ 4.25
CARHSP1-215	ENST00000570125	MYOM2	P54296	1465 aa		41.56	■■■■■ 4.24
CARHSP1-215	ENST00000570125	PTCH1	Q13635	1447 aa		41.54	■■■■■ 4.24
CARHSP1-215	ENST00000570125	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		41.54	■■■■■ 4.24
CARHSP1-215	ENST00000570125	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CARHSP1-215	ENST00000570125	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		41.53	■■■■■ 4.24
CARHSP1-215	ENST00000570125	SLAIN2	Q9P270	581 aa		41.52	■■■■■ 4.24
CARHSP1-215	ENST00000570125	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		41.5	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		41.49	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		41.49	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	ATF3	P18847	181 aa		41.48	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	DCC	P43146	1447 aa		41.47	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		41.46	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		41.46	■■■■■ 4.23
CARHSP1-215	ENST00000570125	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		41.41	■■■■■ 4.22
CARHSP1-215	ENST00000570125	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	41.41	■■■■■ 4.22
CARHSP1-215	ENST00000570125	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	41.4	■■■■■ 4.22
CARHSP1-215	ENST00000570125	LAMC1	P11047	1609 aa		41.4	■■■■■ 4.22
CARHSP1-215	ENST00000570125	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
CARHSP1-215	ENST00000570125	TECPR2	O15040	1411 aa		41.38	■■■■■ 4.22
CARHSP1-215	ENST00000570125	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	41.37	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		41.37	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		41.37	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	STK26	Q9P289	416 aa		41.36	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		41.35	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		41.35	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	ABCC11	Q96J66	1382 aa		41.34	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	41.34	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	MST1R	Q04912	1400 aa		41.33	■■■■■ 4.21
CARHSP1-215	ENST00000570125	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		41.3	■■■■■ 4.2
CARHSP1-215	ENST00000570125	STAC3	Q96MF2	364 aa		41.29	■■■■■ 4.2
CARHSP1-215	ENST00000570125	PHLPP1	O60346	1717 aa		41.27	■■■■■ 4.2
CARHSP1-215	ENST00000570125	BRINP3	Q76B58	766 aa		41.25	■■■■■ 4.19
CARHSP1-215	ENST00000570125	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	41.25	■■■■■ 4.19
CARHSP1-215	ENST00000570125	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		41.24	■■■■■ 4.19
CARHSP1-215	ENST00000570125	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		41.23	■■■■■ 4.19
CARHSP1-215	ENST00000570125	ADGRB1	O14514	1584 aa		41.22	■■■■■ 4.19
CARHSP1-215	ENST00000570125	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	41.21	■■■■■ 4.19
CARHSP1-215	ENST00000570125	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	41.19	■■■■■ 4.18
CARHSP1-215	ENST00000570125	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		41.18	■■■■■ 4.18
CARHSP1-215	ENST00000570125	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.17	■■■■■ 4.18
CARHSP1-215	ENST00000570125	SIRT1	Q96EB6	747 aa		41.17	■■■■■ 4.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 177.5 ms