RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 CHGAP10645 457 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
RAB40C-211ENST00000568586 SLC26A8Q96RN1 970 aa44.19■■■■■ 4.66
RAB40C-211ENST00000568586 TOM1O60784 492 aa44.17■■■■■ 4.66
RAB40C-211ENST00000568586 KCNA6P17658 529 aa44.16■■■■■ 4.66
RAB40C-211ENST00000568586 TRIM52Q96A61 297 aa44.16■■■■■ 4.66
RAB40C-211ENST00000568586 TRPM2O94759 1503 aa44.14■■■■■ 4.66
RAB40C-211ENST00000568586 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
RAB40C-211ENST00000568586 ALKQ9UM73 1620 aa44.1■■■■■ 4.65
RAB40C-211ENST00000568586 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
RAB40C-211ENST00000568586 TBX22Q9Y458 520 aa44.08■■■■■ 4.65
RAB40C-211ENST00000568586 BCANQ96GW7 911 aa44.06■■■■■ 4.64
RAB40C-211ENST00000568586 CLTCL1P53675 1640 aa44.05■■■■■ 4.64
RAB40C-211ENST00000568586 NWD1Q149M9 1564 aa44.05■■■■■ 4.64
RAB40C-211ENST00000568586 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa44.03■■■■■ 4.64
RAB40C-211ENST00000568586 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 DIP2AQ14689 1571 aa43.97■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM94Q12767 1356 aa43.96■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 PIP4K2BP78356 416 aa43.96■■■■■ 4.63
RAB40C-211ENST00000568586 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 PIK3R4Q99570 1358 aa43.93■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.92■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.9■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.89■■■■■ 4.62
RAB40C-211ENST00000568586 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
RAB40C-211ENST00000568586 KIF1BO60333 1816 aa43.87■■■■■ 4.61
RAB40C-211ENST00000568586 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa43.87■■■■■ 4.61
RAB40C-211ENST00000568586 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa43.87■■■■■ 4.61
RAB40C-211ENST00000568586 HSPA1LP34931 641 aa43.84■■■■■ 4.61
RAB40C-211ENST00000568586 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa43.83■■■■■ 4.61
RAB40C-211ENST00000568586 FOXD1Q16676 465 aa43.81■■■■■ 4.6
RAB40C-211ENST00000568586 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa43.79■■■■■ 4.6
RAB40C-211ENST00000568586 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.78■■■■■ 4.6
RAB40C-211ENST00000568586 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
RAB40C-211ENST00000568586 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa43.74■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 PTPRUQ92729 1446 aa43.73■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 VGFO15240 615 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa43.7■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.7■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 FAM135BQ49AJ0 1406 aa43.7■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 MSH6P52701 1360 aa43.69■■■■■ 4.59
RAB40C-211ENST00000568586 METP08581 1390 aa43.66■■■■■ 4.58
RAB40C-211ENST00000568586 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.65■■■■■ 4.58
RAB40C-211ENST00000568586 HRCP23327 699 aa43.64■■■■■ 4.58
RAB40C-211ENST00000568586 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
RAB40C-211ENST00000568586 DISP3Q9P2K9 1392 aa43.59■■■■■ 4.57
RAB40C-211ENST00000568586 PPLO60437 1756 aa43.59■■■■■ 4.57
RAB40C-211ENST00000568586 C19orf44Q9H6X5 657 aa43.56■■■■■ 4.56
RAB40C-211ENST00000568586 SLAIN2Q9P270 581 aa43.55■■■■■ 4.56
RAB40C-211ENST00000568586 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa43.49■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa43.47■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 C14orf37Q86TY3 774 aa43.47■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 CADPS2Q86UW7 1296 aa43.47■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 RGL3Q3MIN7 710 aa43.46■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 PRAG1Q86YV5 1406 aa43.46■■■■■ 4.55
RAB40C-211ENST00000568586 DCCP43146 1447 aa43.44■■■■■ 4.54
RAB40C-211ENST00000568586 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa43.43■■■■■ 4.54
RAB40C-211ENST00000568586 IFT172Q9UG01 1749 aa43.42■■■■■ 4.54
RAB40C-211ENST00000568586 ATF3P18847 181 aa43.4■■■■■ 4.54
RAB40C-211ENST00000568586 PTCH1Q13635 1447 aa43.39■■■■■ 4.54
RAB40C-211ENST00000568586 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
RAB40C-211ENST00000568586 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa43.33■■■■■ 4.53
RAB40C-211ENST00000568586 PIK3C2GO75747 1445 aa43.31■■■■■ 4.52
RAB40C-211ENST00000568586 ROBO2Q9HCK4 1378 aa43.31■■■■■ 4.52
RAB40C-211ENST00000568586 ILDR2Q71H61 639 aa43.27■■■■■ 4.52
RAB40C-211ENST00000568586 NRXN1Q9ULB1 1477 aa43.26■■■■■ 4.52
RAB40C-211ENST00000568586 MYOM2P54296 1465 aa43.24■■■■■ 4.51
RAB40C-211ENST00000568586 MST1RQ04912 1400 aa43.23■■■■■ 4.51
RAB40C-211ENST00000568586 NALCNQ8IZF0 1738 aa43.21■■■■■ 4.51
RAB40C-211ENST00000568586 TECPR2O15040 1411 aa43.2■■■■■ 4.51
RAB40C-211ENST00000568586 BRINP3Q76B58 766 aa43.19■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 PHLPP1O60346 1717 aa43.18■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP43.18■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa43.17■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 ABCC11Q96J66 1382 aa43.16■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP43.15■■■■■ 4.5
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM132EQ6IEE7 984 aa43.1■■■■■ 4.49
RAB40C-211ENST00000568586 JCADQ9P266 1359 aa43.1■■■■■ 4.49
RAB40C-211ENST00000568586 STAC3Q96MF2 364 aa43.08■■■■■ 4.49
RAB40C-211ENST00000568586 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 SIRT1Q96EB6 747 aa43.06■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 KNDC1Q76NI1 1749 aa43.05■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 LAMC1P11047 1609 aa43.05■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 STK26Q9P289 416 aa43.05■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 CFAP70Q5T0N1 1121 aa43.04■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 C1orf167Q5SNV9 1468 aa43.04■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
RAB40C-211ENST00000568586 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42.99■■■■■ 4.47
RAB40C-211ENST00000568586 NHSL1Q5SYE7 1610 aa42.98■■■■■ 4.47
RAB40C-211ENST00000568586 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
RAB40C-211ENST00000568586 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.98■■■■■ 4.47
RAB40C-211ENST00000568586 DCAF11Q8TEB1 546 aa42.96■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms