RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIP4K2BP78356 416 aa25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.66■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM52Q96A61 297 aa25.64■■□□□ 1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.64■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPM2O94759 1503 aa25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPA1LP34931 641 aa25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.63■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.61■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.57■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 BCANQ96GW7 911 aa25.56■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLTCL1P53675 1640 aa25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNA6P17658 529 aa25.55■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIP2AQ14689 1571 aa25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 NWD1Q149M9 1564 aa25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALKQ9UM73 1620 aa25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBX22Q9Y458 520 aa25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.52■■□□□ 1.68
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF1BO60333 1816 aa25.51■■□□□ 1.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIK3R4Q99570 1358 aa25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM94Q12767 1356 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXD1Q16676 465 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 HRCP23327 699 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSH6P52701 1360 aa25.33■■□□□ 1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPLO60437 1756 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTPRUQ92729 1446 aa25.29■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.28■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 METP08581 1390 aa25.26■■□□□ 1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.25■■□□□ 1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 C14orf37Q86TY3 774 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 IFT172Q9UG01 1749 aa25.21■■□□□ 1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCCP43146 1447 aa25.2■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGL3Q3MIN7 710 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLAIN2Q9P270 581 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.19■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.18■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTCH1Q13635 1447 aa25.17■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATF3P18847 181 aa25.16■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.13■■□□□ 1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 PIK3C2GO75747 1445 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYOM2P54296 1465 aa25.11■■□□□ 1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.09■■□□□ 1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.06■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 LAMC1P11047 1609 aa25.05■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 TECPR2O15040 1411 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAC3Q96MF2 364 aa25.04■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHLPP1O60346 1717 aa25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 MST1RQ04912 1400 aa25.03■■□□□ 1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCC11Q96J66 1382 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.01■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 KNDC1Q76NI1 1749 aa25■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 POTEAQ6S8J7 498 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRINP3Q76B58 766 aa24.98■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 JCADQ9P266 1359 aa24.95■■□□□ 1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIRT1Q96EB6 747 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 STK26Q9P289 416 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.92■■□□□ 1.58
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