RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563367.1

NME3-203, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 3

Gene NME3, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-203ENST00000563367 CLTCL1P53675 1640 aa42.31■■■■■ 4.36
NME3-203ENST00000563367 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 KIF1BO60333 1816 aa42.22■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 FOXD1Q16676 465 aa42.21■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 SLC26A8Q96RN1 970 aa42.21■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.2■■■■■ 4.35
NME3-203ENST00000563367 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.19■■■■■ 4.34
NME3-203ENST00000563367 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa42.19■■■■■ 4.34
NME3-203ENST00000563367 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.18■■■■■ 4.34
NME3-203ENST00000563367 BCANQ96GW7 911 aa42.16■■■■■ 4.34
NME3-203ENST00000563367 LRRC7Q96NW7 1537 aa42.13■■■■■ 4.33
NME3-203ENST00000563367 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
NME3-203ENST00000563367 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
NME3-203ENST00000563367 UBAP1LF5GYI3 381 aa42.06■■■■■ 4.32
NME3-203ENST00000563367 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
NME3-203ENST00000563367 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.04■■■■■ 4.32
NME3-203ENST00000563367 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.03■■■■■ 4.32
NME3-203ENST00000563367 KCNA6P17658 529 aa42.03■■■■■ 4.32
NME3-203ENST00000563367 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
NME3-203ENST00000563367 TBX22Q9Y458 520 aa42■■■■■ 4.31
NME3-203ENST00000563367 NWD1Q149M9 1564 aa42■■■■■ 4.31
NME3-203ENST00000563367 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.98■■■■■ 4.31
NME3-203ENST00000563367 DIP2AQ14689 1571 aa41.96■■■■■ 4.31
NME3-203ENST00000563367 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.95■■■■■ 4.31
NME3-203ENST00000563367 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.93■■■■■ 4.3
NME3-203ENST00000563367 ALKQ9UM73 1620 aa41.92■■■■■ 4.3
NME3-203ENST00000563367 HRCP23327 699 aa41.91■■■■■ 4.3
NME3-203ENST00000563367 PPLO60437 1756 aa41.9■■■■■ 4.3
NME3-203ENST00000563367 TOM1O60784 492 aa41.89■■■■■ 4.3
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NME3-203ENST00000563367 TMEM94Q12767 1356 aa41.87■■■■■ 4.29
NME3-203ENST00000563367 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
NME3-203ENST00000563367 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
NME3-203ENST00000563367 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.84■■■■■ 4.29
NME3-203ENST00000563367 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.84■■■■■ 4.29
NME3-203ENST00000563367 PIK3R4Q99570 1358 aa41.83■■■■■ 4.29
NME3-203ENST00000563367 PIP4K2BP78356 416 aa41.81■■■■■ 4.28
NME3-203ENST00000563367 PTPRUQ92729 1446 aa41.79■■■■■ 4.28
NME3-203ENST00000563367 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.79■■■■■ 4.28
NME3-203ENST00000563367 RGL3Q3MIN7 710 aa41.78■■■■■ 4.28
NME3-203ENST00000563367 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
NME3-203ENST00000563367 IFT172Q9UG01 1749 aa41.76■■■■■ 4.28
NME3-203ENST00000563367 METP08581 1390 aa41.75■■■■■ 4.27
NME3-203ENST00000563367 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
NME3-203ENST00000563367 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.73■■■■■ 4.27
NME3-203ENST00000563367 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.72■■■■■ 4.27
NME3-203ENST00000563367 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
NME3-203ENST00000563367 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.65■■■■■ 4.26
NME3-203ENST00000563367 MSH6P52701 1360 aa41.6■■■■■ 4.25
NME3-203ENST00000563367 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.6■■■■■ 4.25
NME3-203ENST00000563367 HSPA1LP34931 641 aa41.59■■■■■ 4.25
NME3-203ENST00000563367 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
NME3-203ENST00000563367 C14orf37Q86TY3 774 aa41.52■■■■■ 4.24
NME3-203ENST00000563367 PIK3C2GO75747 1445 aa41.49■■■■■ 4.23
NME3-203ENST00000563367 C19orf44Q9H6X5 657 aa41.47■■■■■ 4.23
NME3-203ENST00000563367 FAM135BQ49AJ0 1406 aa41.46■■■■■ 4.23
NME3-203ENST00000563367 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa41.45■■■■■ 4.23
NME3-203ENST00000563367 MYOM2P54296 1465 aa41.45■■■■■ 4.23
NME3-203ENST00000563367 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.44■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 SLAIN2Q9P270 581 aa41.43■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 ROBO2Q9HCK4 1378 aa41.4■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa41.4■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 PTCH1Q13635 1447 aa41.4■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 PRAG1Q86YV5 1406 aa41.4■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 NALCNQ8IZF0 1738 aa41.39■■■■■ 4.22
NME3-203ENST00000563367 ATF3P18847 181 aa41.37■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 CADPS2Q86UW7 1296 aa41.37■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.35■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.34■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa41.33■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 DCCP43146 1447 aa41.32■■■■■ 4.21
NME3-203ENST00000563367 LAMC1P11047 1609 aa41.31■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.31■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.3■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 STK26Q9P289 416 aa41.3■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.3■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.28■■■■■ 4.2
NME3-203ENST00000563367 TECPR2O15040 1411 aa41.26■■■■■ 4.19
NME3-203ENST00000563367 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
NME3-203ENST00000563367 ABCC11Q96J66 1382 aa41.24■■■■■ 4.19
NME3-203ENST00000563367 MST1RQ04912 1400 aa41.22■■■■■ 4.19
NME3-203ENST00000563367 PHLPP1O60346 1717 aa41.21■■■■■ 4.19
NME3-203ENST00000563367 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.18■■■■■ 4.18
NME3-203ENST00000563367 STAC3Q96MF2 364 aa41.18■■■■■ 4.18
NME3-203ENST00000563367 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.16■■■■■ 4.18
NME3-203ENST00000563367 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.14■■■■■ 4.18
NME3-203ENST00000563367 BRINP3Q76B58 766 aa41.14■■■■■ 4.18
NME3-203ENST00000563367 ADGRB1O14514 1584 aa41.13■■■■■ 4.18
NME3-203ENST00000563367 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.12■■■■■ 4.17
NME3-203ENST00000563367 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.11■■■■■ 4.17
NME3-203ENST00000563367 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
NME3-203ENST00000563367 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
NME3-203ENST00000563367 SIRT1Q96EB6 747 aa41.07■■■■■ 4.17
NME3-203ENST00000563367 C1orf167Q5SNV9 1468 aa41.06■■■■■ 4.16
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