RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HDGFP51858 240 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.8■■■□□ 2.84
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.79■■■□□ 2.84
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.77■■■□□ 2.84
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CERKQ8TCT0 537 aa32.75■■■□□ 2.83
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPS1P31327 1500 aa32.72■■■□□ 2.83
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.72■■■□□ 2.83
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.68■■■□□ 2.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BCANQ96GW7 911 aa32.66■■■□□ 2.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DIP2AQ14689 1571 aa32.66■■■□□ 2.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.64■■■□□ 2.82
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.63■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.63■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.63■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.63■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.62■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.6■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPLO60437 1756 aa32.6■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.58■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NWD1Q149M9 1564 aa32.58■■■□□ 2.81
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TBX22Q9Y458 520 aa32.57■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FBXO41Q8TF61 875 aa32.55■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFT172Q9UG01 1749 aa32.54■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KCNA6P17658 529 aa32.52■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIK3R4Q99570 1358 aa32.52■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.51■■■□□ 2.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGL3Q3MIN7 710 aa32.5■■■□□ 2.79
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYOM2P54296 1465 aa32.41■■■□□ 2.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALKQ9UM73 1620 aa32.4■■■□□ 2.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.38■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTPRUQ92729 1446 aa32.37■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METP08581 1390 aa32.36■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM94Q12767 1356 aa32.36■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIK3C2GO75747 1445 aa32.35■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NRXN1Q9ULB1 1477 aa32.35■■■□□ 2.77
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.32■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.32■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAMC1P11047 1609 aa32.29■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.28■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TOM1O60784 492 aa32.27■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STAC3Q96MF2 364 aa32.27■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.26■■■□□ 2.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF11Q8TEB1 546 aa32.23■■■□□ 2.75
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MSH6P52701 1360 aa32.22■■■□□ 2.75
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PTCH1Q13635 1447 aa32.22■■■□□ 2.75
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa32.21■■■□□ 2.75
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.21■■■□□ 2.75
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa32.18■■■□□ 2.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KNDC1Q76NI1 1749 aa32.15■■■□□ 2.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C14orf37Q86TY3 774 aa32.14■■■□□ 2.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TECPR2O15040 1411 aa32.14■■■□□ 2.74
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CFAP70Q5T0N1 1121 aa32.13■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.13■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ROBO2Q9HCK4 1378 aa32.12■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIP4K2BP78356 416 aa32.11■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCCP43146 1447 aa32.1■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM132EQ6IEE7 984 aa32.1■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.1■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.09■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABCC11Q96J66 1382 aa32.09■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.08■■■□□ 2.73
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADGRB1O14514 1584 aa32.07■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEUROD1Q13562 356 aa32.07■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa32.04■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.04■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STK26Q9P289 416 aa32.04■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.03■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATF3P18847 181 aa32.02■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.01■■■□□ 2.72
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DLC1Q96QB1 1528 aa32■■■□□ 2.71
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SIRT1Q96EB6 747 aa31.98■■■□□ 2.71
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLAIN2Q9P270 581 aa31.98■■■□□ 2.71
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.98■■■□□ 2.71
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.94■■■□□ 2.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TONSLQ96HA7 1378 aa31.94■■■□□ 2.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MST1RQ04912 1400 aa31.92■■■□□ 2.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.92■■■□□ 2.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.92■■■□□ 2.7
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HSPA1LP34931 641 aa31.91■■■□□ 2.7
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