RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 FOXD1Q16676 465 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-211ENST00000559850 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.21■■□□□ 1.15
RABGGTA-211ENST00000559850 KIF1BO60333 1816 aa22.2■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 CPS1P31327 1500 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 BCANQ96GW7 911 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-211ENST00000559850 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
RABGGTA-211ENST00000559850 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.06■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 NWD1Q149M9 1564 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 ALKQ9UM73 1620 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 PPLO60437 1756 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-211ENST00000559850 DIP2AQ14689 1571 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNA6P17658 529 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 PIP4K2BP78356 416 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 TBX22Q9Y458 520 aa21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM94Q12767 1356 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 IFT172Q9UG01 1749 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-211ENST00000559850 RGL3Q3MIN7 710 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 PTPRUQ92729 1446 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 TOM1O60784 492 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 METP08581 1390 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.89■■□□□ 1.1
RABGGTA-211ENST00000559850 HRCP23327 699 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 PIK3R4Q99570 1358 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 HSPA1LP34931 641 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-211ENST00000559850 C14orf37Q86TY3 774 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-211ENST00000559850 MSH6P52701 1360 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-211ENST00000559850 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-211ENST00000559850 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-211ENST00000559850 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-211ENST00000559850 PIK3C2GO75747 1445 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 MYOM2P54296 1465 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 SLAIN2Q9P270 581 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 STK26Q9P289 416 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-211ENST00000559850 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PTCH1Q13635 1447 aa21.7■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 LAMC1P11047 1609 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ATF3P18847 181 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.69■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PHLPP1O60346 1717 aa21.68■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.66■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
RABGGTA-211ENST00000559850 MST1RQ04912 1400 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DCCP43146 1447 aa21.63■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.62■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 TECPR2O15040 1411 aa21.61■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ADGRB1O14514 1584 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 ABCC11Q96J66 1382 aa21.59■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 BRINP3Q76B58 766 aa21.58■■□□□ 1.05
RABGGTA-211ENST00000559850 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-211ENST00000559850 NEUROD1Q13562 356 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-211ENST00000559850 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.56■■□□□ 1.04
RABGGTA-211ENST00000559850 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.55■■□□□ 1.04
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