RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558291.1

GDPGP1-203, Transcript of GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDPGP1, Length 550 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1-203ENST00000558291 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
GDPGP1-203ENST00000558291 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.58■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.57■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 HSPA1LP34931 641 aa26.56■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 ITGAEP38570 1179 aa26.55■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 DIP2AQ14689 1571 aa26.54■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GDPGP1-203ENST00000558291 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.51■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 TMEM94Q12767 1356 aa26.5■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.5■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 PIK3R4Q99570 1358 aa26.48■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 TBX22Q9Y458 520 aa26.48■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 NAIPQ13075 1403 aa26.48■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 BCANQ96GW7 911 aa26.47■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.47■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.47■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 HFM1A2PYH4 1435 aa26.46■■□□□ 1.83
GDPGP1-203ENST00000558291 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 TRPM2O94759 1503 aa26.41■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 ILDR2Q71H61 639 aa26.41■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 MSH6P52701 1360 aa26.41■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.4■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 SOCS7O14512 581 aa26.39■■□□□ 1.82
GDPGP1-203ENST00000558291 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.37■■□□□ 1.81
GDPGP1-203ENST00000558291 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.32■■□□□ 1.8
GDPGP1-203ENST00000558291 CLTCL1P53675 1640 aa26.32■■□□□ 1.8
GDPGP1-203ENST00000558291 KIF1BO60333 1816 aa26.31■■□□□ 1.8
GDPGP1-203ENST00000558291 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
GDPGP1-203ENST00000558291 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.28■■□□□ 1.8
GDPGP1-203ENST00000558291 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.27■■□□□ 1.8
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 SLAIN2Q9P270 581 aa26.26■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 DCCP43146 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.24■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.24■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 TRIM52Q96A61 297 aa26.23■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.21■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.21■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
GDPGP1-203ENST00000558291 PTPRUQ92729 1446 aa26.2■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 C14orf37Q86TY3 774 aa26.19■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 ATF3P18847 181 aa26.17■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 PHLPP1O60346 1717 aa26.17■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.14■■□□□ 1.78
GDPGP1-203ENST00000558291 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 METP08581 1390 aa26.13■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 JCADQ9P266 1359 aa26.13■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 PTCH1Q13635 1447 aa26.11■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 PPLO60437 1756 aa26.1■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.1■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.08■■□□□ 1.77
GDPGP1-203ENST00000558291 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.04■■□□□ 1.76
GDPGP1-203ENST00000558291 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.03■■□□□ 1.76
GDPGP1-203ENST00000558291 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.02■■□□□ 1.76
GDPGP1-203ENST00000558291 MST1RQ04912 1400 aa26.02■■□□□ 1.76
GDPGP1-203ENST00000558291 SHPRHQ149N8 1683 aa26.02■■□□□ 1.76
GDPGP1-203ENST00000558291 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.01■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.01■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 NALCNQ8IZF0 1738 aa26■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 SETD5Q9C0A6 1442 aa26■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 BRINP3Q76B58 766 aa26■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 IFT172Q9UG01 1749 aa25.97■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.97■■□□□ 1.75
GDPGP1-203ENST00000558291 FOXD1Q16676 465 aa25.93■■□□□ 1.74
GDPGP1-203ENST00000558291 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.93■■□□□ 1.74
GDPGP1-203ENST00000558291 LAMC1P11047 1609 aa25.92■■□□□ 1.74
GDPGP1-203ENST00000558291 TECPR2O15040 1411 aa25.91■■□□□ 1.74
GDPGP1-203ENST00000558291 PIK3C2GO75747 1445 aa25.89■■□□□ 1.74
GDPGP1-203ENST00000558291 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.89■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.88■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.88■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.87■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 LRP6O75581 1613 aa25.86■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 MYOM2P54296 1465 aa25.85■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.85■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 ABCC11Q96J66 1382 aa25.84■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 HRCP23327 699 aa25.84■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 RGL3Q3MIN7 710 aa25.84■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 POTEAQ6S8J7 498 aa25.83■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.83■■□□□ 1.73
GDPGP1-203ENST00000558291 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
GDPGP1-203ENST00000558291 SIRT1Q96EB6 747 aa25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms