RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.29■■□□□ 1.8
NEDD1-212ENST00000557478 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.29■■□□□ 1.8
NEDD1-212ENST00000557478 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.28■■□□□ 1.8
NEDD1-212ENST00000557478 TRIM52Q96A61 297 aa26.24■■□□□ 1.79
NEDD1-212ENST00000557478 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.23■■□□□ 1.79
NEDD1-212ENST00000557478 TBX22Q9Y458 520 aa26.23■■□□□ 1.79
NEDD1-212ENST00000557478 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
NEDD1-212ENST00000557478 PIP4K2BP78356 416 aa26.2■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 PIK3R4Q99570 1358 aa26.19■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.15■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 TRPM2O94759 1503 aa26.15■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.15■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 DIP2AQ14689 1571 aa26.15■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
NEDD1-212ENST00000557478 TMEM94Q12767 1356 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD1-212ENST00000557478 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.13■■□□□ 1.77
NEDD1-212ENST00000557478 NWD1Q149M9 1564 aa26.12■■□□□ 1.77
NEDD1-212ENST00000557478 HSPA1LP34931 641 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD1-212ENST00000557478 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD1-212ENST00000557478 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.08■■□□□ 1.77
NEDD1-212ENST00000557478 MSH6P52701 1360 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.07■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.06■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.04■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 ALKQ9UM73 1620 aa26.03■■□□□ 1.76
NEDD1-212ENST00000557478 CLTCL1P53675 1640 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.01■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.98■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.97■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 KIF1BO60333 1816 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 C14orf37Q86TY3 774 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.96■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
NEDD1-212ENST00000557478 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.95■■□□□ 1.74
NEDD1-212ENST00000557478 SLAIN2Q9P270 581 aa25.95■■□□□ 1.74
NEDD1-212ENST00000557478 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
NEDD1-212ENST00000557478 HRCP23327 699 aa25.93■■□□□ 1.74
NEDD1-212ENST00000557478 ATF3P18847 181 aa25.92■■□□□ 1.74
NEDD1-212ENST00000557478 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NEDD1-212ENST00000557478 DCCP43146 1447 aa25.88■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.88■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 PTPRUQ92729 1446 aa25.87■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 METP08581 1390 aa25.86■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.86■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 FOXD1Q16676 465 aa25.86■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.85■■□□□ 1.73
NEDD1-212ENST00000557478 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.81■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 PTCH1Q13635 1447 aa25.8■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.79■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 RGL3Q3MIN7 710 aa25.78■■□□□ 1.72
NEDD1-212ENST00000557478 PPLO60437 1756 aa25.74■■□□□ 1.71
NEDD1-212ENST00000557478 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.74■■□□□ 1.71
NEDD1-212ENST00000557478 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
NEDD1-212ENST00000557478 STAC3Q96MF2 364 aa25.73■■□□□ 1.71
NEDD1-212ENST00000557478 JCADQ9P266 1359 aa25.71■■□□□ 1.71
NEDD1-212ENST00000557478 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.7■■□□□ 1.71
NEDD1-212ENST00000557478 ILDR2Q71H61 639 aa25.7■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 SOCS7O14512 581 aa25.69■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 PIK3C2GO75747 1445 aa25.67■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 BRINP3Q76B58 766 aa25.67■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.66■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 MST1RQ04912 1400 aa25.65■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.64■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 PHLPP1O60346 1717 aa25.64■■□□□ 1.7
NEDD1-212ENST00000557478 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 ABCC11Q96J66 1382 aa25.64■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 MYOM2P54296 1465 aa25.64■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 TECPR2O15040 1411 aa25.63■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 SIRT1Q96EB6 747 aa25.63■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 IFT172Q9UG01 1749 aa25.6■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.6■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.59■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
NEDD1-212ENST00000557478 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.56■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 STK26Q9P289 416 aa25.55■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 LAMC1P11047 1609 aa25.55■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.54■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.52■■□□□ 1.68
NEDD1-212ENST00000557478 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.51■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.49■■□□□ 1.67
NEDD1-212ENST00000557478 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms