RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553878.5

CKB-205, Transcript of creatine kinase B, human

TSL 2

Gene CKB, Length 856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CKB-205	ENST00000553878	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.53	■■■■■ 4.56
CKB-205	ENST00000553878	HRC	P23327	699 aa		43.47	■■■■■ 4.55
CKB-205	ENST00000553878	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.47	■■■■■ 4.55
CKB-205	ENST00000553878	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.43	■■■■■ 4.54
CKB-205	ENST00000553878	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		43.43	■■■■■ 4.54
CKB-205	ENST00000553878	CPS1	P31327	1500 aa		43.43	■■■■■ 4.54
CKB-205	ENST00000553878	FOXD1	Q16676	465 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CKB-205	ENST00000553878	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.4	■■■■■ 4.54
CKB-205	ENST00000553878	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CKB-205	ENST00000553878	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		43.35	■■■■■ 4.53
CKB-205	ENST00000553878	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	43.34	■■■■■ 4.53
CKB-205	ENST00000553878	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.32	■■■■■ 4.53
CKB-205	ENST00000553878	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		43.3	■■■■■ 4.52
CKB-205	ENST00000553878	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.27	■■■■■ 4.52
CKB-205	ENST00000553878	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	43.27	■■■■■ 4.52
CKB-205	ENST00000553878	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		43.26	■■■■■ 4.52
CKB-205	ENST00000553878	DIP2A	Q14689	1571 aa		43.25	■■■■■ 4.51
CKB-205	ENST00000553878	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.25	■■■■■ 4.51
CKB-205	ENST00000553878	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.18	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	TBX22	Q9Y458	520 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	PPL	O60437	1756 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	NWD1	Q149M9	1564 aa		43.16	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		43.13	■■■■■ 4.5
CKB-205	ENST00000553878	KCNA6	P17658	529 aa		43.13	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	43.13	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		43.12	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	43.09	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	PIK3R4	Q99570	1358 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
CKB-205	ENST00000553878	IFT172	Q9UG01	1749 aa		43.05	■■■■■ 4.48
CKB-205	ENST00000553878	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
CKB-205	ENST00000553878	RGL3	Q3MIN7	710 aa		43	■■■■■ 4.47
CKB-205	ENST00000553878	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CKB-205	ENST00000553878	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.93	■■■■■ 4.46
CKB-205	ENST00000553878	TOM1	O60784	492 aa		42.91	■■■■■ 4.46
CKB-205	ENST00000553878	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.9	■■■■■ 4.46
CKB-205	ENST00000553878	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
CKB-205	ENST00000553878	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.46
CKB-205	ENST00000553878	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CKB-205	ENST00000553878	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.86	■■■■■ 4.45
CKB-205	ENST00000553878	MET	P08581	1390 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CKB-205	ENST00000553878	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CKB-205	ENST00000553878	MYOM2	P54296	1465 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CKB-205	ENST00000553878	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.82	■■■■■ 4.45
CKB-205	ENST00000553878	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CKB-205	ENST00000553878	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CKB-205	ENST00000553878	MSH6	P52701	1360 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CKB-205	ENST00000553878	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CKB-205	ENST00000553878	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
CKB-205	ENST00000553878	LAMC1	P11047	1609 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CKB-205	ENST00000553878	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
CKB-205	ENST00000553878	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CKB-205	ENST00000553878	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CKB-205	ENST00000553878	STAC3	Q96MF2	364 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CKB-205	ENST00000553878	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CKB-205	ENST00000553878	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CKB-205	ENST00000553878	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
CKB-205	ENST00000553878	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.6	■■■■■ 4.41
CKB-205	ENST00000553878	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		42.6	■■■■■ 4.41
CKB-205	ENST00000553878	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.58	■■■■■ 4.41
CKB-205	ENST00000553878	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.57	■■■■■ 4.41
CKB-205	ENST00000553878	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
CKB-205	ENST00000553878	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	DCC	P43146	1447 aa		42.54	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.52	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	TECPR2	O15040	1411 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.51	■■■■■ 4.4
CKB-205	ENST00000553878	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	ATF3	P18847	181 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.49	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.45	■■■■■ 4.39
CKB-205	ENST00000553878	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.44	■■■■■ 4.38
CKB-205	ENST00000553878	STK26	Q9P289	416 aa		42.43	■■■■■ 4.38
CKB-205	ENST00000553878	HSPA1L	P34931	641 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CKB-205	ENST00000553878	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CKB-205	ENST00000553878	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CKB-205	ENST00000553878	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CKB-205	ENST00000553878	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CKB-205	ENST00000553878	SIRT1	Q96EB6	747 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CKB-205	ENST00000553878	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CKB-205	ENST00000553878	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CKB-205	ENST00000553878	MST1R	Q04912	1400 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CKB-205	ENST00000553878	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CKB-205	ENST00000553878	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CKB-205	ENST00000553878	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CKB-205	ENST00000553878	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CKB-205	ENST00000553878	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.21	■■■■■ 4.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms