RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552301.1

PRPF40B-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF40B, Length 912 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40B-216ENST00000552301 FOXD1Q16676 465 aa27.34■■□□□ 1.97
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PRPF40B-216ENST00000552301 ZFYVE9O95405 1425 aa27.32■■□□□ 1.96
PRPF40B-216ENST00000552301 HRCP23327 699 aa27.31■■□□□ 1.96
PRPF40B-216ENST00000552301 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
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PRPF40B-216ENST00000552301 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.2■■□□□ 1.94
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PRPF40B-216ENST00000552301 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.18■■□□□ 1.94
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PRPF40B-216ENST00000552301 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.09■■□□□ 1.93
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PRPF40B-216ENST00000552301 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.08■■□□□ 1.93
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PRPF40B-216ENST00000552301 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.08■■□□□ 1.93
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PRPF40B-216ENST00000552301 NWD1Q149M9 1564 aa27.05■■□□□ 1.92
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PRPF40B-216ENST00000552301 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.03■■□□□ 1.92
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PRPF40B-216ENST00000552301 UBAP1LF5GYI3 381 aa27■■□□□ 1.91
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PRPF40B-216ENST00000552301 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.93■■□□□ 1.9
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PRPF40B-216ENST00000552301 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.81■■□□□ 1.88
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PRPF40B-216ENST00000552301 NEUROD1Q13562 356 aa26.73■■□□□ 1.87
PRPF40B-216ENST00000552301 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.73■■□□□ 1.87
PRPF40B-216ENST00000552301 STK26Q9P289 416 aa26.73■■□□□ 1.87
PRPF40B-216ENST00000552301 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.73■■□□□ 1.87
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PRPF40B-216ENST00000552301 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.72■■□□□ 1.87
PRPF40B-216ENST00000552301 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.71■■□□□ 1.87
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PRPF40B-216ENST00000552301 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.7■■□□□ 1.86
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PRPF40B-216ENST00000552301 DCCP43146 1447 aa26.68■■□□□ 1.86
PRPF40B-216ENST00000552301 ABCC11Q96J66 1382 aa26.68■■□□□ 1.86
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PRPF40B-216ENST00000552301 SLAIN2Q9P270 581 aa26.65■■□□□ 1.86
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PRPF40B-216ENST00000552301 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.62■■□□□ 1.85
PRPF40B-216ENST00000552301 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.62■■□□□ 1.85
PRPF40B-216ENST00000552301 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.62■■□□□ 1.85
PRPF40B-216ENST00000552301 ADGRB1O14514 1584 aa26.61■■□□□ 1.85
PRPF40B-216ENST00000552301 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.58■■□□□ 1.85
PRPF40B-216ENST00000552301 TONSLQ96HA7 1378 aa26.58■■□□□ 1.84
PRPF40B-216ENST00000552301 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.57■■□□□ 1.84
PRPF40B-216ENST00000552301 DLC1Q96QB1 1528 aa26.56■■□□□ 1.84
PRPF40B-216ENST00000552301 SIRT1Q96EB6 747 aa26.56■■□□□ 1.84
PRPF40B-216ENST00000552301 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.56■■□□□ 1.84
PRPF40B-216ENST00000552301 ILDR2Q71H61 639 aa26.55■■□□□ 1.84
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