RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549462.1

ITGB7-208, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB7, Length 1,526 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-208ENST00000549462 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 FOXD1Q16676 465 aa29.4■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 BCANQ96GW7 911 aa29.4■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.4■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 CPS1P31327 1500 aa29.39■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.35■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 TRPM2O94759 1503 aa29.35■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.34■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.34■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 CLTCL1P53675 1640 aa29.34■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.34■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 HRCP23327 699 aa29.33■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
ITGB7-208ENST00000549462 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
ITGB7-208ENST00000549462 LRRC7Q96NW7 1537 aa29.29■■■□□ 2.28
ITGB7-208ENST00000549462 KCNA6P17658 529 aa29.26■■■□□ 2.27
ITGB7-208ENST00000549462 TBX22Q9Y458 520 aa29.22■■■□□ 2.27
ITGB7-208ENST00000549462 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.22■■■□□ 2.27
ITGB7-208ENST00000549462 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
ITGB7-208ENST00000549462 PIP4K2BP78356 416 aa29.19■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 TOM1O60784 492 aa29.18■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 KIF1BO60333 1816 aa29.16■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.16■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.15■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 TMEM94Q12767 1356 aa29.15■■■□□ 2.26
ITGB7-208ENST00000549462 NWD1Q149M9 1564 aa29.12■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 RGL3Q3MIN7 710 aa29.11■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 ALKQ9UM73 1620 aa29.11■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.08■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 DIP2AQ14689 1571 aa29.08■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.08■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.08■■■□□ 2.25
ITGB7-208ENST00000549462 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 PTPRUQ92729 1446 aa29.07■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.06■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 METP08581 1390 aa29.06■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 PIK3R4Q99570 1358 aa29.06■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.05■■■□□ 2.24
ITGB7-208ENST00000549462 HSPA1LP34931 641 aa29■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.99■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 PPLO60437 1756 aa28.96■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 C14orf37Q86TY3 774 aa28.96■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 MSH6P52701 1360 aa28.96■■■□□ 2.23
ITGB7-208ENST00000549462 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
ITGB7-208ENST00000549462 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.89■■■□□ 2.22
ITGB7-208ENST00000549462 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.87■■■□□ 2.21
ITGB7-208ENST00000549462 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
ITGB7-208ENST00000549462 SLAIN2Q9P270 581 aa28.86■■■□□ 2.21
ITGB7-208ENST00000549462 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ITGB7-208ENST00000549462 IFT172Q9UG01 1749 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGB7-208ENST00000549462 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.84■■■□□ 2.21
ITGB7-208ENST00000549462 PIK3C2GO75747 1445 aa28.82■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 ATF3P18847 181 aa28.81■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.81■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.81■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.79■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 STK26Q9P289 416 aa28.79■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.78■■■□□ 2.2
ITGB7-208ENST00000549462 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 MYOM2P54296 1465 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 PTCH1Q13635 1447 aa28.76■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.75■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.75■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.73■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.73■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.72■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.71■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 DCCP43146 1447 aa28.7■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.7■■■□□ 2.19
ITGB7-208ENST00000549462 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.69■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.67■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 ABCC11Q96J66 1382 aa28.66■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 MST1RQ04912 1400 aa28.66■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 BRINP3Q76B58 766 aa28.65■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 TECPR2O15040 1411 aa28.64■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.64■■■□□ 2.18
ITGB7-208ENST00000549462 NEUROD1Q13562 356 aa28.59■■■□□ 2.17
ITGB7-208ENST00000549462 STAC3Q96MF2 364 aa28.59■■■□□ 2.17
ITGB7-208ENST00000549462 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.16
ITGB7-208ENST00000549462 LAMC1P11047 1609 aa28.57■■■□□ 2.16
ITGB7-208ENST00000549462 PHLPP1O60346 1717 aa28.56■■■□□ 2.16
ITGB7-208ENST00000549462 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.56■■■□□ 2.16
ITGB7-208ENST00000549462 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
ITGB7-208ENST00000549462 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.54■■■□□ 2.16
ITGB7-208ENST00000549462 ADGRB1O14514 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
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