RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXD8-204ENST00000544999 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 TRIM52Q96A61 297 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 TRPM2O94759 1503 aa25.41■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 TOM1O60784 492 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.4■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 BCANQ96GW7 911 aa25.39■■□□□ 1.66
HOXD8-204ENST00000544999 KCNA6P17658 529 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD8-204ENST00000544999 CLTCL1P53675 1640 aa25.37■■□□□ 1.65
HOXD8-204ENST00000544999 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HOXD8-204ENST00000544999 NWD1Q149M9 1564 aa25.35■■□□□ 1.65
HOXD8-204ENST00000544999 ALKQ9UM73 1620 aa25.33■■□□□ 1.65
HOXD8-204ENST00000544999 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 TBX22Q9Y458 520 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 KIF1BO60333 1816 aa25.32■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 DIP2AQ14689 1571 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 PIP4K2BP78356 416 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.28■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM94Q12767 1356 aa25.27■■□□□ 1.64
HOXD8-204ENST00000544999 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXD8-204ENST00000544999 PIK3R4Q99570 1358 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD8-204ENST00000544999 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXD8-204ENST00000544999 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXD8-204ENST00000544999 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXD8-204ENST00000544999 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.22■■□□□ 1.63
HOXD8-204ENST00000544999 HSPA1LP34931 641 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 PTPRUQ92729 1446 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD8-204ENST00000544999 MSH6P52701 1360 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 PPLO60437 1756 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 METP08581 1390 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXD8-204ENST00000544999 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 HRCP23327 699 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 C14orf37Q86TY3 774 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 IFT172Q9UG01 1749 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXD8-204ENST00000544999 RGL3Q3MIN7 710 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 SLAIN2Q9P270 581 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 DCCP43146 1447 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.97■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 ATF3P18847 181 aa24.96■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 PTCH1Q13635 1447 aa24.95■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.95■■□□□ 1.59
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
HOXD8-204ENST00000544999 PIK3C2GO75747 1445 aa24.91■■□□□ 1.58
HOXD8-204ENST00000544999 PHLPP1O60346 1717 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD8-204ENST00000544999 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.89■■□□□ 1.58
HOXD8-204ENST00000544999 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 MYOM2P54296 1465 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 MST1RQ04912 1400 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 ILDR2Q71H61 639 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.84■■□□□ 1.57
HOXD8-204ENST00000544999 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 TECPR2O15040 1411 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 BRINP3Q76B58 766 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 LAMC1P11047 1609 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 ABCC11Q96J66 1382 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 JCADQ9P266 1359 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.78■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 STK26Q9P289 416 aa24.77■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
HOXD8-204ENST00000544999 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.76■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 STAC3Q96MF2 364 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 SIRT1Q96EB6 747 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXD8-204ENST00000544999 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.71■■□□□ 1.55
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