RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 CLTCL1P53675 1640 aa32.65■■■□□ 2.82
PUS1-211ENST00000544662 HDGFP51858 240 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
PUS1-211ENST00000544662 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
PUS1-211ENST00000544662 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
PUS1-211ENST00000544662 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa32.58■■■□□ 2.81
PUS1-211ENST00000544662 BCANQ96GW7 911 aa32.58■■■□□ 2.81
PUS1-211ENST00000544662 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.58■■■□□ 2.81
PUS1-211ENST00000544662 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 MPHOSPH9Q99550 1183 aa32.57■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa32.57■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 KIF1BO60333 1816 aa32.56■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 FOXD1Q16676 465 aa32.55■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 LRRC7Q96NW7 1537 aa32.51■■■□□ 2.8
PUS1-211ENST00000544662 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
PUS1-211ENST00000544662 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.49■■■□□ 2.79
PUS1-211ENST00000544662 KCNA6P17658 529 aa32.46■■■□□ 2.79
PUS1-211ENST00000544662 TBX22Q9Y458 520 aa32.44■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa32.44■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.43■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 NWD1Q149M9 1564 aa32.42■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 DIP2AQ14689 1571 aa32.41■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 CCDC144AA2RUR9 1427 aa32.4■■■□□ 2.78
PUS1-211ENST00000544662 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa32.37■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa32.36■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 TOM1O60784 492 aa32.36■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 HRCP23327 699 aa32.36■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa32.33■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 TMEM94Q12767 1356 aa32.32■■■□□ 2.77
PUS1-211ENST00000544662 ALKQ9UM73 1620 aa32.32■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 PPLO60437 1756 aa32.31■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 PIK3R4Q99570 1358 aa32.31■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.29■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 VGFO15240 615 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 PIP4K2BP78356 416 aa32.28■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
PUS1-211ENST00000544662 PTPRUQ92729 1446 aa32.25■■■□□ 2.75
PUS1-211ENST00000544662 RGL3Q3MIN7 710 aa32.24■■■□□ 2.75
PUS1-211ENST00000544662 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.22■■■□□ 2.75
PUS1-211ENST00000544662 METP08581 1390 aa32.21■■■□□ 2.75
PUS1-211ENST00000544662 IFT172Q9UG01 1749 aa32.2■■■□□ 2.75
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.19■■■□□ 2.74
PUS1-211ENST00000544662 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
PUS1-211ENST00000544662 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
PUS1-211ENST00000544662 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa32.14■■■□□ 2.74
PUS1-211ENST00000544662 MSH6P52701 1360 aa32.14■■■□□ 2.74
PUS1-211ENST00000544662 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.13■■■□□ 2.73
PUS1-211ENST00000544662 HSPA1LP34931 641 aa32.11■■■□□ 2.73
PUS1-211ENST00000544662 C14orf37Q86TY3 774 aa32.09■■■□□ 2.73
PUS1-211ENST00000544662 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
PUS1-211ENST00000544662 PIK3C2GO75747 1445 aa32.02■■■□□ 2.72
PUS1-211ENST00000544662 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.02■■■□□ 2.72
PUS1-211ENST00000544662 FAM135BQ49AJ0 1406 aa32.01■■■□□ 2.72
PUS1-211ENST00000544662 MYOM2P54296 1465 aa32.01■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 SLAIN2Q9P270 581 aa31.99■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa31.99■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 NRXN1Q9ULB1 1477 aa31.98■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 PTCH1Q13635 1447 aa31.98■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 ROBO2Q9HCK4 1378 aa31.96■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 ATF3P18847 181 aa31.96■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 PRAG1Q86YV5 1406 aa31.96■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.95■■■□□ 2.71
PUS1-211ENST00000544662 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa31.94■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 NALCNQ8IZF0 1738 aa31.93■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa31.92■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 DCCP43146 1447 aa31.92■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 TMEM132EQ6IEE7 984 aa31.91■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 LAMC1P11047 1609 aa31.9■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.89■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PUS1-211ENST00000544662 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.88■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 STK26Q9P289 416 aa31.88■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.88■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.87■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 TECPR2O15040 1411 aa31.85■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 KNDC1Q76NI1 1749 aa31.85■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 ABCC11Q96J66 1382 aa31.84■■■□□ 2.69
PUS1-211ENST00000544662 STAC3Q96MF2 364 aa31.82■■■□□ 2.68
PUS1-211ENST00000544662 MST1RQ04912 1400 aa31.82■■■□□ 2.68
PUS1-211ENST00000544662 PHLPP1O60346 1717 aa31.8■■■□□ 2.68
PUS1-211ENST00000544662 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.8■■■□□ 2.68
PUS1-211ENST00000544662 WAPLQ7Z5K2 1190 aa31.78■■■□□ 2.68
PUS1-211ENST00000544662 BRINP3Q76B58 766 aa31.76■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 ADGRB1O14514 1584 aa31.74■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa31.74■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 SIRT1Q96EB6 747 aa31.72■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 SIN3AQ96ST3 1273 aa31.71■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
PUS1-211ENST00000544662 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa31.7■■■□□ 2.67
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