RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543125.5

PGA3-207, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-207ENST00000543125 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.45□□□□□ -0.26
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PGA3-207ENST00000543125 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.44□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.44□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 CLTCL1P53675 1640 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 HRCP23327 699 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 IQGAP1P46940 1657 aa13.43□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 MED14O60244 1454 aa13.42□□□□□ -0.26
PGA3-207ENST00000543125 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.42□□□□□ -0.26
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PGA3-207ENST00000543125 LTKP29376 864 aa13.42□□□□□ -0.26
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PGA3-207ENST00000543125 ZFYVE9O95405 1425 aa13.39□□□□□ -0.27
PGA3-207ENST00000543125 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
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PGA3-207ENST00000543125 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
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PGA3-207ENST00000543125 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
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PGA3-207ENST00000543125 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa13.31□□□□□ -0.28
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PGA3-207ENST00000543125 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.3□□□□□ -0.28
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PGA3-207ENST00000543125 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.29□□□□□ -0.28
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PGA3-207ENST00000543125 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
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PGA3-207ENST00000543125 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.26□□□□□ -0.29
PGA3-207ENST00000543125 KCNA6P17658 529 aa13.25□□□□□ -0.29
PGA3-207ENST00000543125 NWD1Q149M9 1564 aa13.24□□□□□ -0.29
PGA3-207ENST00000543125 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.23□□□□□ -0.29
PGA3-207ENST00000543125 TOM1O60784 492 aa13.23□□□□□ -0.29
PGA3-207ENST00000543125 PIK3R4Q99570 1358 aa13.22□□□□□ -0.29
PGA3-207ENST00000543125 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.22□□□□□ -0.29
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PGA3-207ENST00000543125 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.18□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa13.18□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 PIK3C2GO75747 1445 aa13.17□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.16□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 NRXN1Q9ULB1 1477 aa13.16□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 NEUROD1Q13562 356 aa13.15□□□□□ -0.3
PGA3-207ENST00000543125 STAC3Q96MF2 364 aa13.15□□□□□ -0.3
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PGA3-207ENST00000543125 C14orf37Q86TY3 774 aa13.14□□□□□ -0.31
PGA3-207ENST00000543125 MSH6P52701 1360 aa13.13□□□□□ -0.31
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PGA3-207ENST00000543125 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.12□□□□□ -0.31
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PGA3-207ENST00000543125 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PGA3-207ENST00000543125 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.08□□□□□ -0.32
PGA3-207ENST00000543125 ABCC11Q96J66 1382 aa13.07□□□□□ -0.32
PGA3-207ENST00000543125 ATF3P18847 181 aa13.07□□□□□ -0.32
PGA3-207ENST00000543125 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.07□□□□□ -0.32
PGA3-207ENST00000543125 TECPR2O15040 1411 aa13.06□□□□□ -0.32
PGA3-207ENST00000543125 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa13.06□□□□□ -0.32
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PGA3-207ENST00000543125 ADGRB1O14514 1584 aa13.06□□□□□ -0.32
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