RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.42■■■■□ 3.58
TM7SF3-212ENST00000543088 TRPM2O94759 1503 aa37.41■■■■□ 3.58
TM7SF3-212ENST00000543088 BCANQ96GW7 911 aa37.4■■■■□ 3.58
TM7SF3-212ENST00000543088 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.4■■■■□ 3.58
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.36■■■■□ 3.57
TM7SF3-212ENST00000543088 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.34■■■■□ 3.57
TM7SF3-212ENST00000543088 CLTCL1P53675 1640 aa37.33■■■■□ 3.57
TM7SF3-212ENST00000543088 TOM1O60784 492 aa37.31■■■■□ 3.56
TM7SF3-212ENST00000543088 KIF1BO60333 1816 aa37.28■■■■□ 3.56
TM7SF3-212ENST00000543088 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.27■■■■□ 3.56
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNA6P17658 529 aa37.26■■■■□ 3.56
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
TM7SF3-212ENST00000543088 DIP2AQ14689 1571 aa37.25■■■■□ 3.55
TM7SF3-212ENST00000543088 NWD1Q149M9 1564 aa37.25■■■■□ 3.55
TM7SF3-212ENST00000543088 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
TM7SF3-212ENST00000543088 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
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TM7SF3-212ENST00000543088 TBX22Q9Y458 520 aa37.19■■■■□ 3.54
TM7SF3-212ENST00000543088 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
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TM7SF3-212ENST00000543088 PIP4K2BP78356 416 aa37.16■■■■□ 3.54
TM7SF3-212ENST00000543088 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.16■■■■□ 3.54
TM7SF3-212ENST00000543088 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.16■■■■□ 3.54
TM7SF3-212ENST00000543088 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.13■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM94Q12767 1356 aa37.13■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 PIK3R4Q99570 1358 aa37.13■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.12■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.11■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 FOXD1Q16676 465 aa37.1■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 ALKQ9UM73 1620 aa37.1■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.1■■■■□ 3.53
TM7SF3-212ENST00000543088 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.06■■■■□ 3.52
TM7SF3-212ENST00000543088 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.03■■■■□ 3.52
TM7SF3-212ENST00000543088 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
TM7SF3-212ENST00000543088 MSH6P52701 1360 aa36.98■■■■□ 3.51
TM7SF3-212ENST00000543088 PPLO60437 1756 aa36.96■■■■□ 3.51
TM7SF3-212ENST00000543088 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.96■■■■□ 3.51
TM7SF3-212ENST00000543088 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
TM7SF3-212ENST00000543088 HSPA1LP34931 641 aa36.94■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.92■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 HRCP23327 699 aa36.91■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 PTPRUQ92729 1446 aa36.91■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.89■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 C14orf37Q86TY3 774 aa36.89■■■■□ 3.5
TM7SF3-212ENST00000543088 METP08581 1390 aa36.87■■■■□ 3.49
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.84■■■■□ 3.49
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.83■■■■□ 3.49
TM7SF3-212ENST00000543088 RGL3Q3MIN7 710 aa36.83■■■■□ 3.49
TM7SF3-212ENST00000543088 IFT172Q9UG01 1749 aa36.82■■■■□ 3.49
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TM7SF3-212ENST00000543088 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.78■■■■□ 3.48
TM7SF3-212ENST00000543088 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.77■■■■□ 3.48
TM7SF3-212ENST00000543088 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
TM7SF3-212ENST00000543088 ATF3P18847 181 aa36.74■■■■□ 3.47
TM7SF3-212ENST00000543088 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.74■■■■□ 3.47
TM7SF3-212ENST00000543088 SLAIN2Q9P270 581 aa36.74■■■■□ 3.47
TM7SF3-212ENST00000543088 DCCP43146 1447 aa36.72■■■■□ 3.47
TM7SF3-212ENST00000543088 PTCH1Q13635 1447 aa36.71■■■■□ 3.47
TM7SF3-212ENST00000543088 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.71■■■■□ 3.47
TM7SF3-212ENST00000543088 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.68■■■■□ 3.46
TM7SF3-212ENST00000543088 PIK3C2GO75747 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
TM7SF3-212ENST00000543088 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.65■■■■□ 3.46
TM7SF3-212ENST00000543088 MYOM2P54296 1465 aa36.64■■■■□ 3.46
TM7SF3-212ENST00000543088 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
TM7SF3-212ENST00000543088 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.61■■■■□ 3.45
TM7SF3-212ENST00000543088 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.59■■■■□ 3.45
TM7SF3-212ENST00000543088 LAMC1P11047 1609 aa36.58■■■■□ 3.45
TM7SF3-212ENST00000543088 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.57■■■■□ 3.45
TM7SF3-212ENST00000543088 PHLPP1O60346 1717 aa36.57■■■■□ 3.45
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TM7SF3-212ENST00000543088 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.51■■■■□ 3.44
TM7SF3-212ENST00000543088 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.51■■■■□ 3.44
TM7SF3-212ENST00000543088 TECPR2O15040 1411 aa36.51■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 STK26Q9P289 416 aa36.47■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 ABCC11Q96J66 1382 aa36.46■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 STAC3Q96MF2 364 aa36.46■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 BRINP3Q76B58 766 aa36.45■■■■□ 3.43
TM7SF3-212ENST00000543088 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.42■■■■□ 3.42
TM7SF3-212ENST00000543088 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
TM7SF3-212ENST00000543088 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.41■■■■□ 3.42
TM7SF3-212ENST00000543088 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
TM7SF3-212ENST00000543088 JCADQ9P266 1359 aa36.4■■■■□ 3.42
TM7SF3-212ENST00000543088 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa36.4■■■■□ 3.42
TM7SF3-212ENST00000543088 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.37■■■■□ 3.41
TM7SF3-212ENST00000543088 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.37■■■■□ 3.41
TM7SF3-212ENST00000543088 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.36■■■■□ 3.41
TM7SF3-212ENST00000543088 SIRT1Q96EB6 747 aa36.33■■■■□ 3.41
TM7SF3-212ENST00000543088 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.32■■■■□ 3.4
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