RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539594.5

ESRRA-206, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-206ENST00000539594 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.76■■■■■ 4.28
ESRRA-206ENST00000539594 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.75■■■■■ 4.27
ESRRA-206ENST00000539594 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.7■■■■■ 4.27
ESRRA-206ENST00000539594 CLTCL1P53675 1640 aa41.69■■■■■ 4.27
ESRRA-206ENST00000539594 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
ESRRA-206ENST00000539594 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.69■■■■■ 4.26
ESRRA-206ENST00000539594 KIF1BO60333 1816 aa41.67■■■■■ 4.26
ESRRA-206ENST00000539594 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.66■■■■■ 4.26
ESRRA-206ENST00000539594 BCANQ96GW7 911 aa41.61■■■■■ 4.25
ESRRA-206ENST00000539594 HRCP23327 699 aa41.6■■■■■ 4.25
ESRRA-206ENST00000539594 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
ESRRA-206ENST00000539594 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.57■■■■■ 4.24
ESRRA-206ENST00000539594 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.56■■■■■ 4.24
ESRRA-206ENST00000539594 FOXD1Q16676 465 aa41.54■■■■■ 4.24
ESRRA-206ENST00000539594 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.5■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 KCNA6P17658 529 aa41.48■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 TBX22Q9Y458 520 aa41.48■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 DIP2AQ14689 1571 aa41.47■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.47■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.45■■■■■ 4.23
ESRRA-206ENST00000539594 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.44■■■■■ 4.22
ESRRA-206ENST00000539594 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.42■■■■■ 4.22
ESRRA-206ENST00000539594 NWD1Q149M9 1564 aa41.41■■■■■ 4.22
ESRRA-206ENST00000539594 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.4■■■■■ 4.22
ESRRA-206ENST00000539594 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
ESRRA-206ENST00000539594 PIK3R4Q99570 1358 aa41.38■■■■■ 4.22
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ESRRA-206ENST00000539594 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
ESRRA-206ENST00000539594 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.37■■■■■ 4.21
ESRRA-206ENST00000539594 VGFO15240 615 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
ESRRA-206ENST00000539594 TOM1O60784 492 aa41.35■■■■■ 4.21
ESRRA-206ENST00000539594 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.32■■■■■ 4.2
ESRRA-206ENST00000539594 PPLO60437 1756 aa41.3■■■■■ 4.2
ESRRA-206ENST00000539594 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.29■■■■■ 4.2
ESRRA-206ENST00000539594 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
ESRRA-206ENST00000539594 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
ESRRA-206ENST00000539594 TMEM94Q12767 1356 aa41.25■■■■■ 4.19
ESRRA-206ENST00000539594 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.22■■■■■ 4.19
ESRRA-206ENST00000539594 RGL3Q3MIN7 710 aa41.2■■■■■ 4.19
ESRRA-206ENST00000539594 IFT172Q9UG01 1749 aa41.16■■■■■ 4.18
ESRRA-206ENST00000539594 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa41.15■■■■■ 4.18
ESRRA-206ENST00000539594 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa41.15■■■■■ 4.18
ESRRA-206ENST00000539594 PTPRUQ92729 1446 aa41.12■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 ALKQ9UM73 1620 aa41.12■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 PIP4K2BP78356 416 aa41.11■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 METP08581 1390 aa41.11■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 MSH6P52701 1360 aa41.09■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
ESRRA-206ENST00000539594 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
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ESRRA-206ENST00000539594 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa41.04■■■■■ 4.16
ESRRA-206ENST00000539594 MYOM2P54296 1465 aa40.99■■■■■ 4.15
ESRRA-206ENST00000539594 C14orf37Q86TY3 774 aa40.98■■■■■ 4.15
ESRRA-206ENST00000539594 PIK3C2GO75747 1445 aa40.97■■■■■ 4.15
ESRRA-206ENST00000539594 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.94■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.93■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.92■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 STAC3Q96MF2 364 aa40.92■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 PTCH1Q13635 1447 aa40.92■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.9■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
ESRRA-206ENST00000539594 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.88■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 HSPA1LP34931 641 aa40.86■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 LAMC1P11047 1609 aa40.85■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 DCCP43146 1447 aa40.85■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 ATF3P18847 181 aa40.85■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 SLAIN2Q9P270 581 aa40.84■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
ESRRA-206ENST00000539594 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.81■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.79■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.79■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.78■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 TECPR2O15040 1411 aa40.77■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.76■■■■■ 4.12
ESRRA-206ENST00000539594 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 ABCC11Q96J66 1382 aa40.74■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.74■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.74■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.73■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.73■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 NALCNQ8IZF0 1738 aa40.73■■■■■ 4.11
ESRRA-206ENST00000539594 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
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ESRRA-206ENST00000539594 SIRT1Q96EB6 747 aa40.65■■■■■ 4.1
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ESRRA-206ENST00000539594 ADGRB1O14514 1584 aa40.57■■■■■ 4.09
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ESRRA-206ENST00000539594 DLC1Q96QB1 1528 aa40.54■■■■■ 4.08
ESRRA-206ENST00000539594 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.53■■■■■ 4.08
ESRRA-206ENST00000539594 BRINP3Q76B58 766 aa40.53■■■■■ 4.08
ESRRA-206ENST00000539594 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.53■■■■■ 4.08
ESRRA-206ENST00000539594 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.5■■■■■ 4.07
ESRRA-206ENST00000539594 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
ESRRA-206ENST00000539594 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.49■■■■■ 4.07
ESRRA-206ENST00000539594 C1orf167Q5SNV9 1468 aa40.48■■■■■ 4.07
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