RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529566.1

TSPAN4-218, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 706 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-218ENST00000529566 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.99■■□□□ 1.43
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TSPAN4-218ENST00000529566 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.93■■□□□ 1.42
TSPAN4-218ENST00000529566 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.92■■□□□ 1.42
TSPAN4-218ENST00000529566 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TSPAN4-218ENST00000529566 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
TSPAN4-218ENST00000529566 FBXO41Q8TF61 875 aa23.89■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.89■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.86■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 CPS1P31327 1500 aa23.86■■□□□ 1.41
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TSPAN4-218ENST00000529566 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.86■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.84■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.84■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 TBX22Q9Y458 520 aa23.83■■□□□ 1.41
TSPAN4-218ENST00000529566 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.82■■□□□ 1.4
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TSPAN4-218ENST00000529566 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.82■■□□□ 1.4
TSPAN4-218ENST00000529566 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.81■■□□□ 1.4
TSPAN4-218ENST00000529566 KCNA6P17658 529 aa23.8■■□□□ 1.4
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TSPAN4-218ENST00000529566 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.79■■□□□ 1.4
TSPAN4-218ENST00000529566 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.77■■□□□ 1.4
TSPAN4-218ENST00000529566 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.76■■□□□ 1.39
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TSPAN4-218ENST00000529566 RGL3Q3MIN7 710 aa23.74■■□□□ 1.39
TSPAN4-218ENST00000529566 NWD1Q149M9 1564 aa23.73■■□□□ 1.39
TSPAN4-218ENST00000529566 PIK3R4Q99570 1358 aa23.72■■□□□ 1.39
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TSPAN4-218ENST00000529566 METP08581 1390 aa23.69■■□□□ 1.38
TSPAN4-218ENST00000529566 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.68■■□□□ 1.38
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TSPAN4-218ENST00000529566 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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TSPAN4-218ENST00000529566 TMEM94Q12767 1356 aa23.66■■□□□ 1.38
TSPAN4-218ENST00000529566 IFT172Q9UG01 1749 aa23.65■■□□□ 1.38
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TSPAN4-218ENST00000529566 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.65■■□□□ 1.38
TSPAN4-218ENST00000529566 ALKQ9UM73 1620 aa23.64■■□□□ 1.38
TSPAN4-218ENST00000529566 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TSPAN4-218ENST00000529566 TOM1O60784 492 aa23.61■■□□□ 1.37
TSPAN4-218ENST00000529566 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.59■■□□□ 1.37
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TSPAN4-218ENST00000529566 PIK3C2GO75747 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
TSPAN4-218ENST00000529566 MYOM2P54296 1465 aa23.57■■□□□ 1.36
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TSPAN4-218ENST00000529566 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.52■■□□□ 1.36
TSPAN4-218ENST00000529566 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.52■■□□□ 1.36
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TSPAN4-218ENST00000529566 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.5■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 PTCH1Q13635 1447 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
TSPAN4-218ENST00000529566 TECPR2O15040 1411 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 ABCC11Q96J66 1382 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 C14orf37Q86TY3 774 aa23.44■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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TSPAN4-218ENST00000529566 HSPA1LP34931 641 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 STK26Q9P289 416 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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TSPAN4-218ENST00000529566 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.41■■□□□ 1.34
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TSPAN4-218ENST00000529566 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 DCCP43146 1447 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-218ENST00000529566 ATF3P18847 181 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 ADGRB1O14514 1584 aa23.39■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 NEUROD1Q13562 356 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 SIRT1Q96EB6 747 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.37■■□□□ 1.33
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TSPAN4-218ENST00000529566 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa23.33■■□□□ 1.33
TSPAN4-218ENST00000529566 MST1RQ04912 1400 aa23.33■■□□□ 1.32
TSPAN4-218ENST00000529566 DLC1Q96QB1 1528 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN4-218ENST00000529566 BRINP3Q76B58 766 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPAN4-218ENST00000529566 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.27■■□□□ 1.32
TSPAN4-218ENST00000529566 PRAM1Q96QH2 718 aa23.27■■□□□ 1.32
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