RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526116.5

EML3-215, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-215	ENST00000526116	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.98	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	31.96	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	NWD1	Q149M9	1564 aa		31.95	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		31.95	■■■□□ 2.71
EML3-215	ENST00000526116	ALK	Q9UM73	1620 aa		31.93	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	31.93	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	KIF1B	O60333	1816 aa		31.93	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	DIP2A	Q14689	1571 aa		31.9	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	TOM1	O60784	492 aa		31.89	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	KCNA6	P17658	529 aa		31.89	■■■□□ 2.7
EML3-215	ENST00000526116	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		31.87	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	BCAN	Q96GW7	911 aa		31.87	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.84	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	TBX22	Q9Y458	520 aa		31.84	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.84	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		31.82	■■■□□ 2.69
EML3-215	ENST00000526116	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.81	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	TMEM94	Q12767	1356 aa		31.8	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.78	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.77	■■■□□ 2.68
EML3-215	ENST00000526116	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.76	■■■□□ 2.67
EML3-215	ENST00000526116	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
EML3-215	ENST00000526116	FOXD1	Q16676	465 aa		31.74	■■■□□ 2.67
EML3-215	ENST00000526116	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
EML3-215	ENST00000526116	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.72	■■■□□ 2.67
EML3-215	ENST00000526116	PPL	O60437	1756 aa		31.71	■■■□□ 2.67
EML3-215	ENST00000526116	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.68	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.66	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	HSPA1L	P34931	641 aa		31.66	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	31.65	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.65	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.65	■■■□□ 2.66
EML3-215	ENST00000526116	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.62	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	MSH6	P52701	1360 aa		31.61	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.61	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	MET	P08581	1390 aa		31.59	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.59	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.58	■■■□□ 2.65
EML3-215	ENST00000526116	HRC	P23327	699 aa		31.55	■■■□□ 2.64
EML3-215	ENST00000526116	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
EML3-215	ENST00000526116	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.54	■■■□□ 2.64
EML3-215	ENST00000526116	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.48	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.47	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.47	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.46	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.46	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.45	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.45	■■■□□ 2.63
EML3-215	ENST00000526116	DCC	P43146	1447 aa		31.44	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.43	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.43	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.41	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.41	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.4	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.39	■■■□□ 2.62
EML3-215	ENST00000526116	ATF3	P18847	181 aa		31.37	■■■□□ 2.61
EML3-215	ENST00000526116	MYOM2	P54296	1465 aa		31.36	■■■□□ 2.61
EML3-215	ENST00000526116	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.36	■■■□□ 2.61
EML3-215	ENST00000526116	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.35	■■■□□ 2.61
EML3-215	ENST00000526116	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.35	■■■□□ 2.61
EML3-215	ENST00000526116	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.34	■■■□□ 2.61
EML3-215	ENST00000526116	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.31	■■■□□ 2.6
EML3-215	ENST00000526116	LAMC1	P11047	1609 aa		31.31	■■■□□ 2.6
EML3-215	ENST00000526116	MST1R	Q04912	1400 aa		31.3	■■■□□ 2.6
EML3-215	ENST00000526116	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
EML3-215	ENST00000526116	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
EML3-215	ENST00000526116	TECPR2	O15040	1411 aa		31.29	■■■□□ 2.6
EML3-215	ENST00000526116	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
EML3-215	ENST00000526116	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.22	■■■□□ 2.59
EML3-215	ENST00000526116	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
EML3-215	ENST00000526116	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.21	■■■□□ 2.59
EML3-215	ENST00000526116	ILDR2	Q71H61	639 aa		31.21	■■■□□ 2.59
EML3-215	ENST00000526116	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.2	■■■□□ 2.59
EML3-215	ENST00000526116	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.18	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.18	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.16	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.15	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	STK26	Q9P289	416 aa		31.15	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.14	■■■□□ 2.58
EML3-215	ENST00000526116	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.13	■■■□□ 2.57
EML3-215	ENST00000526116	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.13	■■■□□ 2.57
EML3-215	ENST00000526116	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
EML3-215	ENST00000526116	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.12	■■■□□ 2.57
EML3-215	ENST00000526116	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.11	■■■□□ 2.57
EML3-215	ENST00000526116	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.09	■■■□□ 2.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms