RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 KCNA6P17658 529 aa30.72■■■□□ 2.51
PTDSS2-202ENST00000525059 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
PTDSS2-202ENST00000525059 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.7■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 TBX22Q9Y458 520 aa30.65■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.64■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 TRIM52Q96A61 297 aa30.64■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 BCANQ96GW7 911 aa30.64■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 ALKQ9UM73 1620 aa30.64■■■□□ 2.5
PTDSS2-202ENST00000525059 PIP4K2BP78356 416 aa30.62■■■□□ 2.49
PTDSS2-202ENST00000525059 TRPM2O94759 1503 aa30.59■■■□□ 2.49
PTDSS2-202ENST00000525059 NWD1Q149M9 1564 aa30.58■■■□□ 2.49
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
PTDSS2-202ENST00000525059 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.57■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM94Q12767 1356 aa30.56■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 PIK3R4Q99570 1358 aa30.54■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 HSPA1LP34931 641 aa30.53■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 CLTCL1P53675 1640 aa30.52■■■□□ 2.48
PTDSS2-202ENST00000525059 DIP2AQ14689 1571 aa30.51■■■□□ 2.47
PTDSS2-202ENST00000525059 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
PTDSS2-202ENST00000525059 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
PTDSS2-202ENST00000525059 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.46■■■□□ 2.47
PTDSS2-202ENST00000525059 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.44■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.44■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.42■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.42■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.42■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.41■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.41■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 KIF1BO60333 1816 aa30.4■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.39■■■□□ 2.46
PTDSS2-202ENST00000525059 MSH6P52701 1360 aa30.39■■■□□ 2.45
PTDSS2-202ENST00000525059 FOXD1Q16676 465 aa30.38■■■□□ 2.45
PTDSS2-202ENST00000525059 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.38■■■□□ 2.45
PTDSS2-202ENST00000525059 PTPRUQ92729 1446 aa30.38■■■□□ 2.45
PTDSS2-202ENST00000525059 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PTDSS2-202ENST00000525059 METP08581 1390 aa30.32■■■□□ 2.44
PTDSS2-202ENST00000525059 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.31■■■□□ 2.44
PTDSS2-202ENST00000525059 SLAIN2Q9P270 581 aa30.31■■■□□ 2.44
PTDSS2-202ENST00000525059 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.3■■■□□ 2.44
PTDSS2-202ENST00000525059 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.28■■■□□ 2.44
PTDSS2-202ENST00000525059 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.26■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 HRCP23327 699 aa30.25■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.25■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 C14orf37Q86TY3 774 aa30.24■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 ILDR2Q71H61 639 aa30.21■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.2■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 ATF3P18847 181 aa30.2■■■□□ 2.43
PTDSS2-202ENST00000525059 PPLO60437 1756 aa30.2■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 DCCP43146 1447 aa30.19■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.18■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 RGL3Q3MIN7 710 aa30.17■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.16■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.14■■■□□ 2.42
PTDSS2-202ENST00000525059 PTCH1Q13635 1447 aa30.12■■■□□ 2.41
PTDSS2-202ENST00000525059 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.09■■■□□ 2.41
PTDSS2-202ENST00000525059 ROBO2Q9HCK4 1378 aa30.07■■■□□ 2.4
PTDSS2-202ENST00000525059 IFT172Q9UG01 1749 aa30.07■■■□□ 2.4
PTDSS2-202ENST00000525059 BRINP3Q76B58 766 aa30.04■■■□□ 2.4
PTDSS2-202ENST00000525059 PIK3C2GO75747 1445 aa30.04■■■□□ 2.4
PTDSS2-202ENST00000525059 MST1RQ04912 1400 aa30.04■■■□□ 2.4
PTDSS2-202ENST00000525059 PHLPP1O60346 1717 aa30■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 JCADQ9P266 1359 aa30■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.99■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 TECPR2O15040 1411 aa29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 SOCS7O14512 581 aa29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 ABCC11Q96J66 1382 aa29.98■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.97■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 MYOM2P54296 1465 aa29.97■■■□□ 2.39
PTDSS2-202ENST00000525059 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.93■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.93■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 SIRT1Q96EB6 747 aa29.92■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 STAC3Q96MF2 364 aa29.92■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.91■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 STK26Q9P289 416 aa29.89■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.89■■■□□ 2.38
PTDSS2-202ENST00000525059 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
PTDSS2-202ENST00000525059 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.88■■■□□ 2.37
PTDSS2-202ENST00000525059 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.86■■■□□ 2.37
PTDSS2-202ENST00000525059 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PTDSS2-202ENST00000525059 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.84■■■□□ 2.37
PTDSS2-202ENST00000525059 LAMC1P11047 1609 aa29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 229.1 ms