RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519842.1

HOXA7-202, Transcript of homeobox A7, humanhuman

TSL 3

Gene HOXA7, Length 585 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7-202ENST00000519842 TOM1O60784 492 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 NWD1Q149M9 1564 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 HSPA1LP34931 641 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXA7-202ENST00000519842 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
HOXA7-202ENST00000519842 NAIPQ13075 1403 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXA7-202ENST00000519842 ILDR2Q71H61 639 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXA7-202ENST00000519842 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
HOXA7-202ENST00000519842 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXA7-202ENST00000519842 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 BCANQ96GW7 911 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 CLTCL1P53675 1640 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 TMEM94Q12767 1356 aa28.3■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 KCNA6P17658 529 aa28.27■■■□□ 2.12
HOXA7-202ENST00000519842 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.25■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 HFM1A2PYH4 1435 aa28.24■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 DIP2AQ14689 1571 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 TRPM2O94759 1503 aa28.23■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 KIF1BO60333 1816 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.2■■■□□ 2.11
HOXA7-202ENST00000519842 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
HOXA7-202ENST00000519842 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.15■■■□□ 2.1
HOXA7-202ENST00000519842 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
HOXA7-202ENST00000519842 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.13■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 TRIM52Q96A61 297 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 TBX22Q9Y458 520 aa28.12■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 PTPRUQ92729 1446 aa28.11■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 MSH6P52701 1360 aa28.1■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.09■■■□□ 2.09
HOXA7-202ENST00000519842 PIK3R4Q99570 1358 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXA7-202ENST00000519842 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
HOXA7-202ENST00000519842 PHLPP1O60346 1717 aa28.04■■■□□ 2.08
HOXA7-202ENST00000519842 PPLO60437 1756 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXA7-202ENST00000519842 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 FOXD1Q16676 465 aa28■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 METP08581 1390 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 SOCS7O14512 581 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 C14orf37Q86TY3 774 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXA7-202ENST00000519842 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
HOXA7-202ENST00000519842 SLAIN2Q9P270 581 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXA7-202ENST00000519842 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
HOXA7-202ENST00000519842 IFT172Q9UG01 1749 aa27.92■■■□□ 2.06
HOXA7-202ENST00000519842 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 ATF3P18847 181 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 DCCP43146 1447 aa27.83■■■□□ 2.05
HOXA7-202ENST00000519842 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 MST1RQ04912 1400 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.81■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 PTCH1Q13635 1447 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 SHPRHQ149N8 1683 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXA7-202ENST00000519842 JCADQ9P266 1359 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 BRINP3Q76B58 766 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 LRP6O75581 1613 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 RGL3Q3MIN7 710 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.72■■■□□ 2.03
HOXA7-202ENST00000519842 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.68■■■□□ 2.02
HOXA7-202ENST00000519842 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HOXA7-202ENST00000519842 PIK3C2GO75747 1445 aa27.66■■■□□ 2.02
HOXA7-202ENST00000519842 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXA7-202ENST00000519842 POTEAQ6S8J7 498 aa27.65■■■□□ 2.02
HOXA7-202ENST00000519842 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.64■■■□□ 2.02
HOXA7-202ENST00000519842 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.62■■■□□ 2.01
HOXA7-202ENST00000519842 LAMC1P11047 1609 aa27.61■■■□□ 2.01
HOXA7-202ENST00000519842 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.59■■■□□ 2.01
HOXA7-202ENST00000519842 STK26Q9P289 416 aa27.58■■■□□ 2.01
HOXA7-202ENST00000519842 TECPR2O15040 1411 aa27.58■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 MYOM2P54296 1465 aa27.57■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.57■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.57■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.57■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 ORAI2Q96SN7 254 aa27.54■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
HOXA7-202ENST00000519842 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms