RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.25■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP38.23■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 BCANQ96GW7 911 aa38.23■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 STRCP1A6NGW2 1772 aa38.23■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 CLTCL1P53675 1640 aa38.21■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 SLC26A8Q96RN1 970 aa38.21■■■■□ 3.71
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa38.19■■■■□ 3.7
TCEA1-202ENST00000517351 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP38.18■■■■□ 3.7
TCEA1-202ENST00000517351 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP38.17■■■■□ 3.7
TCEA1-202ENST00000517351 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
TCEA1-202ENST00000517351 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.15■■■■□ 3.7
TCEA1-202ENST00000517351 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.14■■■■□ 3.7
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.69
TCEA1-202ENST00000517351 LRRC7Q96NW7 1537 aa38.12■■■■□ 3.69
TCEA1-202ENST00000517351 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.12■■■■□ 3.69
TCEA1-202ENST00000517351 FOXD1Q16676 465 aa38.12■■■■□ 3.69
TCEA1-202ENST00000517351 KIF1BO60333 1816 aa38.1■■■■□ 3.69
TCEA1-202ENST00000517351 KCNA6P17658 529 aa38.07■■■■□ 3.68
TCEA1-202ENST00000517351 TBX22Q9Y458 520 aa38.03■■■■□ 3.68
TCEA1-202ENST00000517351 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa38.01■■■■□ 3.68
TCEA1-202ENST00000517351 TOM1O60784 492 aa38■■■■□ 3.67
TCEA1-202ENST00000517351 NWD1Q149M9 1564 aa37.99■■■■□ 3.67
TCEA1-202ENST00000517351 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.98■■■■□ 3.67
TCEA1-202ENST00000517351 DIP2AQ14689 1571 aa37.97■■■■□ 3.67
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.96■■■■□ 3.67
TCEA1-202ENST00000517351 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM94Q12767 1356 aa37.92■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.91■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 PIP4K2BP78356 416 aa37.9■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.9■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 PIK3R4Q99570 1358 aa37.89■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.88■■■■□ 3.66
TCEA1-202ENST00000517351 HRCP23327 699 aa37.88■■■■□ 3.65
TCEA1-202ENST00000517351 ALKQ9UM73 1620 aa37.87■■■■□ 3.65
TCEA1-202ENST00000517351 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
TCEA1-202ENST00000517351 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
TCEA1-202ENST00000517351 PPLO60437 1756 aa37.8■■■■□ 3.64
TCEA1-202ENST00000517351 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.79■■■■□ 3.64
TCEA1-202ENST00000517351 RGL3Q3MIN7 710 aa37.79■■■■□ 3.64
TCEA1-202ENST00000517351 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa37.78■■■■□ 3.64
TCEA1-202ENST00000517351 PTPRUQ92729 1446 aa37.78■■■■□ 3.64
TCEA1-202ENST00000517351 METP08581 1390 aa37.75■■■■□ 3.63
TCEA1-202ENST00000517351 MSH6P52701 1360 aa37.71■■■■□ 3.63
TCEA1-202ENST00000517351 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa37.69■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.68■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 HSPA1LP34931 641 aa37.68■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 IFT172Q9UG01 1749 aa37.67■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 C14orf37Q86TY3 774 aa37.66■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.65■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
TCEA1-202ENST00000517351 FAM135BQ49AJ0 1406 aa37.56■■■■□ 3.6
TCEA1-202ENST00000517351 C19orf44Q9H6X5 657 aa37.56■■■■□ 3.6
TCEA1-202ENST00000517351 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
TCEA1-202ENST00000517351 SLAIN2Q9P270 581 aa37.52■■■■□ 3.6
TCEA1-202ENST00000517351 PIK3C2GO75747 1445 aa37.51■■■■□ 3.59
TCEA1-202ENST00000517351 ATF3P18847 181 aa37.5■■■■□ 3.59
TCEA1-202ENST00000517351 CADPS2Q86UW7 1296 aa37.5■■■■□ 3.59
TCEA1-202ENST00000517351 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa37.49■■■■□ 3.59
TCEA1-202ENST00000517351 MYOM2P54296 1465 aa37.48■■■■□ 3.59
TCEA1-202ENST00000517351 PTCH1Q13635 1447 aa37.47■■■■□ 3.59
TCEA1-202ENST00000517351 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.44■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 ROBO2Q9HCK4 1378 aa37.44■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.44■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 DCCP43146 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.42■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.39■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.39■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.39■■■■□ 3.58
TCEA1-202ENST00000517351 STK26Q9P289 416 aa37.37■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.37■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.36■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.35■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.35■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 LAMC1P11047 1609 aa37.35■■■■□ 3.57
TCEA1-202ENST00000517351 TECPR2O15040 1411 aa37.32■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 ABCC11Q96J66 1382 aa37.31■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 MST1RQ04912 1400 aa37.3■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 STAC3Q96MF2 364 aa37.3■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.29■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 PHLPP1O60346 1717 aa37.26■■■■□ 3.56
TCEA1-202ENST00000517351 BRINP3Q76B58 766 aa37.25■■■■□ 3.55
TCEA1-202ENST00000517351 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.24■■■■□ 3.55
TCEA1-202ENST00000517351 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
TCEA1-202ENST00000517351 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa37.19■■■■□ 3.54
TCEA1-202ENST00000517351 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
TCEA1-202ENST00000517351 SIRT1Q96EB6 747 aa37.17■■■■□ 3.54
TCEA1-202ENST00000517351 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.16■■■■□ 3.54
TCEA1-202ENST00000517351 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRB1O14514 1584 aa37.16■■■■□ 3.54
TCEA1-202ENST00000517351 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.14■■■■□ 3.54
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