RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 BCANQ96GW7 911 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-215ENST00000514625 CLTCL1P53675 1640 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-215ENST00000514625 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.42■■□□□ 1.82
FAAP20-215ENST00000514625 ZFYVE9O95405 1425 aa26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-215ENST00000514625 CERKQ8TCT0 537 aa26.41■■□□□ 1.82
FAAP20-215ENST00000514625 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
FAAP20-215ENST00000514625 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.39■■□□□ 1.81
FAAP20-215ENST00000514625 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.36■■□□□ 1.81
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-215ENST00000514625 KIF1BO60333 1816 aa26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-215ENST00000514625 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
FAAP20-215ENST00000514625 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.32■■□□□ 1.8
FAAP20-215ENST00000514625 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
FAAP20-215ENST00000514625 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.3■■□□□ 1.8
FAAP20-215ENST00000514625 CPS1P31327 1500 aa26.29■■□□□ 1.8
FAAP20-215ENST00000514625 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 FBXO41Q8TF61 875 aa26.25■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 TBX22Q9Y458 520 aa26.25■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.24■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 RGL3Q3MIN7 710 aa26.24■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.24■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.23■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 KCNA6P17658 529 aa26.21■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.21■■□□□ 1.79
FAAP20-215ENST00000514625 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.19■■□□□ 1.78
FAAP20-215ENST00000514625 DIP2AQ14689 1571 aa26.18■■□□□ 1.78
FAAP20-215ENST00000514625 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
FAAP20-215ENST00000514625 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-215ENST00000514625 PIK3R4Q99570 1358 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-215ENST00000514625 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 PPLO60437 1756 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 NWD1Q149M9 1564 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-215ENST00000514625 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.07■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.07■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 TOM1O60784 492 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM94Q12767 1356 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 METP08581 1390 aa26.05■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 IFT172Q9UG01 1749 aa26.03■■□□□ 1.76
FAAP20-215ENST00000514625 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 PTPRUQ92729 1446 aa26.01■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 STAC3Q96MF2 364 aa26.01■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 ALKQ9UM73 1620 aa26.01■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF11Q8TEB1 546 aa26■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 MYOM2P54296 1465 aa25.99■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.99■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 PIK3C2GO75747 1445 aa25.98■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 C14orf37Q86TY3 774 aa25.98■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.98■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.96■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 MSH6P52701 1360 aa25.95■■□□□ 1.75
FAAP20-215ENST00000514625 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 PIP4K2BP78356 416 aa25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 NEUROD1Q13562 356 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.91■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.9■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.89■■□□□ 1.74
FAAP20-215ENST00000514625 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.88■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 STK26Q9P289 416 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 PTCH1Q13635 1447 aa25.87■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 LAMC1P11047 1609 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 ATF3P18847 181 aa25.86■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.84■■□□□ 1.73
FAAP20-215ENST00000514625 ABCC11Q96J66 1382 aa25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 SLAIN2Q9P270 581 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.81■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 TECPR2O15040 1411 aa25.8■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.79■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 DCCP43146 1447 aa25.78■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
FAAP20-215ENST00000514625 SIRT1Q96EB6 747 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.76■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 HSPA1LP34931 641 aa25.74■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.74■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.74■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 TONSLQ96HA7 1378 aa25.73■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 ADGRB1O14514 1584 aa25.72■■□□□ 1.71
FAAP20-215ENST00000514625 POGKQ9P215 609 aa25.7■■□□□ 1.7
FAAP20-215ENST00000514625 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.7■■□□□ 1.7
FAAP20-215ENST00000514625 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.7■■□□□ 1.7
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.69■■□□□ 1.7
FAAP20-215ENST00000514625 PRAM1Q96QH2 718 aa25.68■■□□□ 1.7
FAAP20-215ENST00000514625 DLC1Q96QB1 1528 aa25.68■■□□□ 1.7
FAAP20-215ENST00000514625 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms