RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 ZFYVE9O95405 1425 aa29.33■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 ALKQ9UM73 1620 aa29.33■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.33■■■□□ 2.29
CTBP1-211ENST00000511907 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.32■■■□□ 2.28
CTBP1-211ENST00000511907 BCANQ96GW7 911 aa29.31■■■□□ 2.28
CTBP1-211ENST00000511907 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
CTBP1-211ENST00000511907 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.25■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 HFM1A2PYH4 1435 aa29.24■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.24■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 KCNA6P17658 529 aa29.22■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 HSPA1LP34931 641 aa29.22■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 NWD1Q149M9 1564 aa29.22■■■□□ 2.27
CTBP1-211ENST00000511907 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
CTBP1-211ENST00000511907 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CTBP1-211ENST00000511907 TRIM52Q96A61 297 aa29.18■■■□□ 2.26
CTBP1-211ENST00000511907 CLTCL1P53675 1640 aa29.17■■■□□ 2.26
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM94Q12767 1356 aa29.17■■■□□ 2.26
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CTBP1-211ENST00000511907 TRPM2O94759 1503 aa29.15■■■□□ 2.26
CTBP1-211ENST00000511907 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
CTBP1-211ENST00000511907 KIF1BO60333 1816 aa29.12■■■□□ 2.25
CTBP1-211ENST00000511907 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.11■■■□□ 2.25
CTBP1-211ENST00000511907 DIP2AQ14689 1571 aa29.11■■■□□ 2.25
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CTBP1-211ENST00000511907 TBX22Q9Y458 520 aa29.09■■■□□ 2.25
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CTBP1-211ENST00000511907 ILDR2Q71H61 639 aa29.01■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.01■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 MSH6P52701 1360 aa29.01■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.99■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 PIK3R4Q99570 1358 aa28.99■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 PTPRUQ92729 1446 aa28.96■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 FOXD1Q16676 465 aa28.96■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.95■■■□□ 2.23
CTBP1-211ENST00000511907 C14orf37Q86TY3 774 aa28.93■■■□□ 2.22
CTBP1-211ENST00000511907 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.93■■■□□ 2.22
CTBP1-211ENST00000511907 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CTBP1-211ENST00000511907 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CTBP1-211ENST00000511907 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.9■■■□□ 2.22
CTBP1-211ENST00000511907 PPLO60437 1756 aa28.89■■■□□ 2.22
CTBP1-211ENST00000511907 METP08581 1390 aa28.88■■■□□ 2.21
CTBP1-211ENST00000511907 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.87■■■□□ 2.21
CTBP1-211ENST00000511907 SLAIN2Q9P270 581 aa28.87■■■□□ 2.21
CTBP1-211ENST00000511907 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.86■■■□□ 2.21
CTBP1-211ENST00000511907 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
CTBP1-211ENST00000511907 PHLPP1O60346 1717 aa28.83■■■□□ 2.21
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.83■■■□□ 2.21
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CTBP1-211ENST00000511907 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-211ENST00000511907 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.81■■■□□ 2.2
CTBP1-211ENST00000511907 ATF3P18847 181 aa28.79■■■□□ 2.2
CTBP1-211ENST00000511907 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.78■■■□□ 2.2
CTBP1-211ENST00000511907 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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CTBP1-211ENST00000511907 IFT172Q9UG01 1749 aa28.76■■■□□ 2.19
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CTBP1-211ENST00000511907 RGL3Q3MIN7 710 aa28.74■■■□□ 2.19
CTBP1-211ENST00000511907 SOCS7O14512 581 aa28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-211ENST00000511907 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.73■■■□□ 2.19
CTBP1-211ENST00000511907 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CTBP1-211ENST00000511907 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CTBP1-211ENST00000511907 DCCP43146 1447 aa28.71■■■□□ 2.19
CTBP1-211ENST00000511907 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.69■■■□□ 2.18
CTBP1-211ENST00000511907 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.68■■■□□ 2.18
CTBP1-211ENST00000511907 PTCH1Q13635 1447 aa28.67■■■□□ 2.18
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CTBP1-211ENST00000511907 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.64■■■□□ 2.18
CTBP1-211ENST00000511907 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.63■■■□□ 2.17
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CTBP1-211ENST00000511907 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.62■■■□□ 2.17
CTBP1-211ENST00000511907 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.6■■■□□ 2.17
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CTBP1-211ENST00000511907 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
CTBP1-211ENST00000511907 PIK3C2GO75747 1445 aa28.57■■■□□ 2.16
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CTBP1-211ENST00000511907 STK26Q9P289 416 aa28.53■■■□□ 2.16
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CTBP1-211ENST00000511907 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.52■■■□□ 2.16
CTBP1-211ENST00000511907 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.51■■■□□ 2.15
CTBP1-211ENST00000511907 MYOM2P54296 1465 aa28.5■■■□□ 2.15
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CTBP1-211ENST00000511907 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.47■■■□□ 2.15
CTBP1-211ENST00000511907 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.47■■■□□ 2.15
CTBP1-211ENST00000511907 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.46■■■□□ 2.15
CTBP1-211ENST00000511907 HRCP23327 699 aa28.46■■■□□ 2.15
CTBP1-211ENST00000511907 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.45■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC11Q96J66 1382 aa28.43■■■□□ 2.14
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