RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507785.2

MSX2-202, Transcript of msh homeobox 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSX2, Length 1,188 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX2-202ENST00000507785 CERKQ8TCT0 537 aa41.56■■■■■ 4.24
MSX2-202ENST00000507785 KIF1BO60333 1816 aa41.55■■■■■ 4.24
MSX2-202ENST00000507785 HDGFP51858 240 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
MSX2-202ENST00000507785 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
MSX2-202ENST00000507785 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa41.45■■■■■ 4.23
MSX2-202ENST00000507785 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.43■■■■■ 4.22
MSX2-202ENST00000507785 CPS1P31327 1500 aa41.39■■■■■ 4.22
MSX2-202ENST00000507785 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
MSX2-202ENST00000507785 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.38■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa41.38■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.37■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.34■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 FBXO41Q8TF61 875 aa41.32■■■■■ 4.21
MSX2-202ENST00000507785 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
MSX2-202ENST00000507785 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa41.28■■■■■ 4.2
MSX2-202ENST00000507785 BCANQ96GW7 911 aa41.28■■■■■ 4.2
MSX2-202ENST00000507785 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
MSX2-202ENST00000507785 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.27■■■■■ 4.2
MSX2-202ENST00000507785 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa41.26■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 PPLO60437 1756 aa41.25■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 DIP2AQ14689 1571 aa41.25■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.25■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa41.24■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 TBX22Q9Y458 520 aa41.23■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa41.22■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 NWD1Q149M9 1564 aa41.21■■■■■ 4.19
MSX2-202ENST00000507785 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.21■■■■■ 4.19
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MSX2-202ENST00000507785 IFT172Q9UG01 1749 aa41.16■■■■■ 4.18
MSX2-202ENST00000507785 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
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MSX2-202ENST00000507785 PIK3R4Q99570 1358 aa41.12■■■■■ 4.17
MSX2-202ENST00000507785 RGL3Q3MIN7 710 aa41.11■■■■■ 4.17
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MSX2-202ENST00000507785 ALKQ9UM73 1620 aa40.99■■■■■ 4.15
MSX2-202ENST00000507785 TMEM94Q12767 1356 aa40.99■■■■■ 4.15
MSX2-202ENST00000507785 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.98■■■■■ 4.15
MSX2-202ENST00000507785 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.98■■■■■ 4.15
MSX2-202ENST00000507785 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
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MSX2-202ENST00000507785 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.93■■■■■ 4.14
MSX2-202ENST00000507785 MYOM2P54296 1465 aa40.91■■■■■ 4.14
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MSX2-202ENST00000507785 TOM1O60784 492 aa40.88■■■■■ 4.13
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MSX2-202ENST00000507785 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
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MSX2-202ENST00000507785 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.67■■■■■ 4.1
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MSX2-202ENST00000507785 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.64■■■■■ 4.1
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MSX2-202ENST00000507785 DLC1Q96QB1 1528 aa40.42■■■■■ 4.06
MSX2-202ENST00000507785 MST1RQ04912 1400 aa40.42■■■■■ 4.06
MSX2-202ENST00000507785 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa40.36■■■■■ 4.05
MSX2-202ENST00000507785 PRAM1Q96QH2 718 aa40.3■■■■■ 4.04
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