RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.28■■■■□ 3.24
PITX1-206ENST00000507253 CLTCL1P53675 1640 aa35.24■■■■□ 3.23
PITX1-206ENST00000507253 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
PITX1-206ENST00000507253 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
PITX1-206ENST00000507253 KIF1BO60333 1816 aa35.21■■■■□ 3.23
PITX1-206ENST00000507253 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.2■■■■□ 3.23
PITX1-206ENST00000507253 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.17■■■■□ 3.22
PITX1-206ENST00000507253 BCANQ96GW7 911 aa35.17■■■■□ 3.22
PITX1-206ENST00000507253 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.17■■■■□ 3.22
PITX1-206ENST00000507253 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.15■■■■□ 3.22
PITX1-206ENST00000507253 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
PITX1-206ENST00000507253 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.1■■■■□ 3.21
PITX1-206ENST00000507253 DIP2AQ14689 1571 aa35.08■■■■□ 3.21
PITX1-206ENST00000507253 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.06■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 FOXD1Q16676 465 aa35.05■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 NWD1Q149M9 1564 aa35.04■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.04■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.04■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.02■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 KCNA6P17658 529 aa35.02■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 HRCP23327 699 aa35.01■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 TBX22Q9Y458 520 aa35.01■■■■□ 3.2
PITX1-206ENST00000507253 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.98■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.98■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 TOM1O60784 492 aa34.95■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa34.95■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 PIK3R4Q99570 1358 aa34.95■■■■□ 3.19
PITX1-206ENST00000507253 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.93■■■■□ 3.18
PITX1-206ENST00000507253 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
PITX1-206ENST00000507253 PPLO60437 1756 aa34.91■■■■□ 3.18
PITX1-206ENST00000507253 VGFO15240 615 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
PITX1-206ENST00000507253 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
PITX1-206ENST00000507253 TMEM94Q12767 1356 aa34.86■■■■□ 3.17
PITX1-206ENST00000507253 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa34.85■■■■□ 3.17
PITX1-206ENST00000507253 IFT172Q9UG01 1749 aa34.81■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 ALKQ9UM73 1620 aa34.79■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 PIP4K2BP78356 416 aa34.78■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.77■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 RGL3Q3MIN7 710 aa34.76■■■■□ 3.16
PITX1-206ENST00000507253 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.75■■■■□ 3.15
PITX1-206ENST00000507253 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.74■■■■□ 3.15
PITX1-206ENST00000507253 MSH6P52701 1360 aa34.74■■■■□ 3.15
PITX1-206ENST00000507253 PTPRUQ92729 1446 aa34.73■■■■□ 3.15
PITX1-206ENST00000507253 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
PITX1-206ENST00000507253 METP08581 1390 aa34.72■■■■□ 3.15
PITX1-206ENST00000507253 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
PITX1-206ENST00000507253 C14orf37Q86TY3 774 aa34.65■■■■□ 3.14
PITX1-206ENST00000507253 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa34.63■■■■□ 3.13
PITX1-206ENST00000507253 MYOM2P54296 1465 aa34.63■■■■□ 3.13
PITX1-206ENST00000507253 PIK3C2GO75747 1445 aa34.6■■■■□ 3.13
PITX1-206ENST00000507253 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
PITX1-206ENST00000507253 PTCH1Q13635 1447 aa34.58■■■■□ 3.13
PITX1-206ENST00000507253 PRAG1Q86YV5 1406 aa34.57■■■■□ 3.13
PITX1-206ENST00000507253 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.56■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 LAMC1P11047 1609 aa34.56■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 HSPA1LP34931 641 aa34.56■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.56■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.55■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.54■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 DCCP43146 1447 aa34.54■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.53■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 ATF3P18847 181 aa34.52■■■■□ 3.12
PITX1-206ENST00000507253 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 SLAIN2Q9P270 581 aa34.49■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 STAC3Q96MF2 364 aa34.48■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.47■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.47■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.45■■■■□ 3.11
PITX1-206ENST00000507253 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
PITX1-206ENST00000507253 TECPR2O15040 1411 aa34.43■■■■□ 3.1
PITX1-206ENST00000507253 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PITX1-206ENST00000507253 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.41■■■■□ 3.1
PITX1-206ENST00000507253 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
PITX1-206ENST00000507253 ABCC11Q96J66 1382 aa34.38■■■■□ 3.09
PITX1-206ENST00000507253 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX1-206ENST00000507253 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.37■■■■□ 3.09
PITX1-206ENST00000507253 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.36■■■■□ 3.09
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PITX1-206ENST00000507253 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
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PITX1-206ENST00000507253 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.29■■■■□ 3.08
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PITX1-206ENST00000507253 ADGRB1O14514 1584 aa34.27■■■■□ 3.08
PITX1-206ENST00000507253 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.26■■■■□ 3.08
PITX1-206ENST00000507253 DLC1Q96QB1 1528 aa34.25■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 BRINP3Q76B58 766 aa34.23■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.22■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
PITX1-206ENST00000507253 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.21■■■■□ 3.07
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