RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
HULC-201ENST00000503668 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.09□□□□□ -0.31
HULC-201ENST00000503668 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.09□□□□□ -0.31
HULC-201ENST00000503668 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 MFSD10Q14728 455 aa13.07□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 CADPS2Q86UW7 1296 aa13.07□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 GRIN2BQ13224 1484 aa13.07□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 SIN3AQ96ST3 1273 aa13.06□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 EMILIN3Q9NT22 766 aa13.06□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 ARHGEF11O15085 1522 aa13.06□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.06□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 ANP32EQ9BTT0 268 aa13.05□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 NAIPQ13075 1403 aa13.05□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 MIA2Q96PC5 1412 aa13.05□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 NCOA2Q15596 1464 aa13.04□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 SLC4A5Q9BY07 1137 aa13.03□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 ADAM33Q9BZ11 813 aa13.03□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 UGGT2Q9NYU1 1516 aa13.03□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.02□□□□□ -0.32
HULC-201ENST00000503668 KCNH8Q96L42 1107 aa13.02□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 STAC3Q96MF2 364 aa13.02□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.02□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 HECW1Q76N89 1606 aa13.02□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 PTPREP23469 700 aa13.01□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 MAP3K9P80192 1104 aa13.01□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 JPH4Q96JJ6 628 aa13.01□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 ZBED2Q9BTP6 218 aa13.01□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.01□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 GAPVD1Q14C86 1478 aa13□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 ZDHHC16Q969W1 377 aa13□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 ROCK1Q13464 1354 aa12.96□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 PTPN5P54829 565 aa12.96□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 P3H3Q8IVL6 736 aa12.96□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.96□□□□□ -0.33
HULC-201ENST00000503668 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
HULC-201ENST00000503668 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.95□□□□□ -0.34
HULC-201ENST00000503668 PTPRKQ15262 1439 aa12.95□□□□□ -0.34
HULC-201ENST00000503668 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP12.93□□□□□ -0.34
HULC-201ENST00000503668 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa12.93□□□□□ -0.34
HULC-201ENST00000503668 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.89□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.89□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 COL9A1P20849 921 aa12.89□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.89□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 IQGAP2Q13576 1575 aa12.89□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 CAMK2BQ13554 666 aa12.87□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 WNT2BQ93097 391 aa12.87□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 NCOA1Q15788 1441 aa12.87□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 PROX2Q3B8N5 592 aa12.86□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 NESP48681 1621 aa12.86□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.85□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 WDR62O43379 1518 aa12.84□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.84□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 PHF14O94880 888 aa12.84□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 MPHOSPH9Q99550 1183 aa12.84□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 PBRM1Q86U86 1689 aa12.83□□□□□ -0.35
HULC-201ENST00000503668 GOLGA8CPA6NN73 597 aa12.83□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 TRIM52Q96A61 297 aa12.83□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 ZBED9Q6R2W3 1325 aa12.83□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 CCDC7Q96M83 1385 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 ADAMTS12P58397 1594 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 DPYSL4O14531 572 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 WASHC2AQ641Q2 1341 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.82□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 RABGEF1Q9UJ41 708 aa12.81□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 BCANQ96GW7 911 aa12.8□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 NBPF3Q9H094 633 aa12.8□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 FBXW7Q969H0 707 aa12.79□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 DAPK1P53355 1430 aa12.79□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa12.79□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.78□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.78□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 TEX14Q8IWB6 1497 aa12.78□□□□□ -0.36
HULC-201ENST00000503668 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.77□□□□□ -0.37
HULC-201ENST00000503668 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
HULC-201ENST00000503668 IFFO2Q5TF58 517 aa12.76□□□□□ -0.37
HULC-201ENST00000503668 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
HULC-201ENST00000503668 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.76□□□□□ -0.37
HULC-201ENST00000503668 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms