RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
CXCL3-202ENST00000502974 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.22■■■■□ 3.55
CXCL3-202ENST00000502974 BCANQ96GW7 911 aa37.22■■■■□ 3.55
CXCL3-202ENST00000502974 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa37.2■■■■□ 3.55
CXCL3-202ENST00000502974 TRPM2O94759 1503 aa37.2■■■■□ 3.55
CXCL3-202ENST00000502974 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
CXCL3-202ENST00000502974 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.17■■■■□ 3.54
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.17■■■■□ 3.54
CXCL3-202ENST00000502974 CLTCL1P53675 1640 aa37.16■■■■□ 3.54
CXCL3-202ENST00000502974 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC7Q96NW7 1537 aa37.15■■■■□ 3.54
CXCL3-202ENST00000502974 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.13■■■■□ 3.53
CXCL3-202ENST00000502974 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.53
CXCL3-202ENST00000502974 FOXD1Q16676 465 aa37.11■■■■□ 3.53
CXCL3-202ENST00000502974 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
CXCL3-202ENST00000502974 KIF1BO60333 1816 aa37.08■■■■□ 3.53
CXCL3-202ENST00000502974 TOM1O60784 492 aa37.07■■■■□ 3.52
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
CXCL3-202ENST00000502974 KCNA6P17658 529 aa37.05■■■■□ 3.52
CXCL3-202ENST00000502974 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
CXCL3-202ENST00000502974 NWD1Q149M9 1564 aa37■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 DIP2AQ14689 1571 aa37■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 PIP4K2BP78356 416 aa36.98■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 TBX22Q9Y458 520 aa36.97■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.95■■■■□ 3.51
CXCL3-202ENST00000502974 HRCP23327 699 aa36.94■■■■□ 3.5
CXCL3-202ENST00000502974 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.93■■■■□ 3.5
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.93■■■■□ 3.5
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM94Q12767 1356 aa36.92■■■■□ 3.5
CXCL3-202ENST00000502974 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
CXCL3-202ENST00000502974 ALKQ9UM73 1620 aa36.91■■■■□ 3.5
CXCL3-202ENST00000502974 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.88■■■■□ 3.49
CXCL3-202ENST00000502974 PIK3R4Q99570 1358 aa36.87■■■■□ 3.49
CXCL3-202ENST00000502974 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.86■■■■□ 3.49
CXCL3-202ENST00000502974 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CXCL3-202ENST00000502974 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.8■■■■□ 3.48
CXCL3-202ENST00000502974 PPLO60437 1756 aa36.77■■■■□ 3.48
CXCL3-202ENST00000502974 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
CXCL3-202ENST00000502974 HSPA1LP34931 641 aa36.75■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 MSH6P52701 1360 aa36.75■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.75■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 RGL3Q3MIN7 710 aa36.73■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.73■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 PTPRUQ92729 1446 aa36.72■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.71■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 C14orf37Q86TY3 774 aa36.7■■■■□ 3.47
CXCL3-202ENST00000502974 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.69■■■■□ 3.46
CXCL3-202ENST00000502974 METP08581 1390 aa36.69■■■■□ 3.46
CXCL3-202ENST00000502974 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CXCL3-202ENST00000502974 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CXCL3-202ENST00000502974 IFT172Q9UG01 1749 aa36.66■■■■□ 3.46
CXCL3-202ENST00000502974 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CXCL3-202ENST00000502974 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.6■■■■□ 3.45
CXCL3-202ENST00000502974 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.57■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.56■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.56■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.56■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 SLAIN2Q9P270 581 aa36.54■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 ATF3P18847 181 aa36.53■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.52■■■■□ 3.44
CXCL3-202ENST00000502974 PTCH1Q13635 1447 aa36.47■■■■□ 3.43
CXCL3-202ENST00000502974 DCCP43146 1447 aa36.46■■■■□ 3.43
CXCL3-202ENST00000502974 MYOM2P54296 1465 aa36.45■■■■□ 3.43
CXCL3-202ENST00000502974 PIK3C2GO75747 1445 aa36.44■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.42■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.42■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.41■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.4■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.39■■■■□ 3.42
CXCL3-202ENST00000502974 PHLPP1O60346 1717 aa36.37■■■■□ 3.41
CXCL3-202ENST00000502974 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.35■■■■□ 3.41
CXCL3-202ENST00000502974 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.34■■■■□ 3.41
CXCL3-202ENST00000502974 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CXCL3-202ENST00000502974 LAMC1P11047 1609 aa36.34■■■■□ 3.41
CXCL3-202ENST00000502974 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.33■■■■□ 3.41
CXCL3-202ENST00000502974 STK26Q9P289 416 aa36.31■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 MST1RQ04912 1400 aa36.31■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.3■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.28■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.28■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 TECPR2O15040 1411 aa36.27■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 BRINP3Q76B58 766 aa36.26■■■■□ 3.4
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC11Q96J66 1382 aa36.25■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 STAC3Q96MF2 364 aa36.24■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.22■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CXCL3-202ENST00000502974 JCADQ9P266 1359 aa36.17■■■■□ 3.38
CXCL3-202ENST00000502974 NEUROD1Q13562 356 aa36.17■■■■□ 3.38
CXCL3-202ENST00000502974 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.17■■■■□ 3.38
CXCL3-202ENST00000502974 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.17■■■■□ 3.38
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