RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
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HOXD11-202ENST00000498438 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.26■■□□□ 1.95
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HOXD11-202ENST00000498438 C14orf37Q86TY3 774 aa27.21■■□□□ 1.95
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HOXD11-202ENST00000498438 BRINP3Q76B58 766 aa26.95■■□□□ 1.9
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HOXD11-202ENST00000498438 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD11-202ENST00000498438 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD11-202ENST00000498438 JCADQ9P266 1359 aa26.88■■□□□ 1.89
HOXD11-202ENST00000498438 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
HOXD11-202ENST00000498438 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.87■■□□□ 1.89
HOXD11-202ENST00000498438 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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HOXD11-202ENST00000498438 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.86■■□□□ 1.89
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