RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496764.6

ARHGEF4-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF4, Length 840 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-210ENST00000496764 FOXD1Q16676 465 aa30.34■■■□□ 2.45
ARHGEF4-210ENST00000496764 FBXO41Q8TF61 875 aa30.32■■■□□ 2.44
ARHGEF4-210ENST00000496764 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF4-210ENST00000496764 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.28■■■□□ 2.44
ARHGEF4-210ENST00000496764 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF4-210ENST00000496764 HRCP23327 699 aa30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.27■■■□□ 2.44
ARHGEF4-210ENST00000496764 CPS1P31327 1500 aa30.26■■■□□ 2.43
ARHGEF4-210ENST00000496764 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF4-210ENST00000496764 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ARHGEF4-210ENST00000496764 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.23■■■□□ 2.43
ARHGEF4-210ENST00000496764 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.21■■■□□ 2.43
ARHGEF4-210ENST00000496764 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 KIF1BO60333 1816 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.17■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 BCANQ96GW7 911 aa30.16■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.14■■■□□ 2.42
ARHGEF4-210ENST00000496764 TBX22Q9Y458 520 aa30.13■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 KCNA6P17658 529 aa30.12■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.11■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.09■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 DIP2AQ14689 1571 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 NWD1Q149M9 1564 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.08■■■□□ 2.41
ARHGEF4-210ENST00000496764 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.07■■■□□ 2.4
ARHGEF4-210ENST00000496764 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.06■■■□□ 2.4
ARHGEF4-210ENST00000496764 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF4-210ENST00000496764 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF4-210ENST00000496764 PIK3R4Q99570 1358 aa30.02■■■□□ 2.4
ARHGEF4-210ENST00000496764 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.01■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 RGL3Q3MIN7 710 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 PPLO60437 1756 aa30■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 TMEM94Q12767 1356 aa29.98■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 PTPRUQ92729 1446 aa29.97■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 ALKQ9UM73 1620 aa29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 METP08581 1390 aa29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF4-210ENST00000496764 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.93■■■□□ 2.38
ARHGEF4-210ENST00000496764 TOM1O60784 492 aa29.92■■■□□ 2.38
ARHGEF4-210ENST00000496764 IFT172Q9UG01 1749 aa29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF4-210ENST00000496764 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.91■■■□□ 2.38
ARHGEF4-210ENST00000496764 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF4-210ENST00000496764 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ARHGEF4-210ENST00000496764 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF4-210ENST00000496764 PIK3C2GO75747 1445 aa29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF4-210ENST00000496764 PIP4K2BP78356 416 aa29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF4-210ENST00000496764 MYOM2P54296 1465 aa29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF4-210ENST00000496764 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF4-210ENST00000496764 MSH6P52701 1360 aa29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF4-210ENST00000496764 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF4-210ENST00000496764 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.77■■■□□ 2.36
ARHGEF4-210ENST00000496764 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 PTCH1Q13635 1447 aa29.73■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.73■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.72■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.71■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 C14orf37Q86TY3 774 aa29.7■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.7■■■□□ 2.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 HSPA1LP34931 641 aa29.69■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.68■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 STAC3Q96MF2 364 aa29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 SLAIN2Q9P270 581 aa29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.66■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 TECPR2O15040 1411 aa29.65■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.64■■■□□ 2.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCC11Q96J66 1382 aa29.64■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 DCCP43146 1447 aa29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 LAMC1P11047 1609 aa29.63■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 ATF3P18847 181 aa29.61■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.61■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 STK26Q9P289 416 aa29.61■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.59■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.58■■■□□ 2.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 ADGRB1O14514 1584 aa29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.57■■■□□ 2.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 MST1RQ04912 1400 aa29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.54■■■□□ 2.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 SIRT1Q96EB6 747 aa29.53■■■□□ 2.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.51■■■□□ 2.31
ARHGEF4-210ENST00000496764 NEUROD1Q13562 356 aa29.5■■■□□ 2.31
ARHGEF4-210ENST00000496764 DLC1Q96QB1 1528 aa29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF4-210ENST00000496764 BRINP3Q76B58 766 aa29.47■■■□□ 2.31
ARHGEF4-210ENST00000496764 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.46■■■□□ 2.31
ARHGEF4-210ENST00000496764 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.44■■■□□ 2.3
ARHGEF4-210ENST00000496764 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.44■■■□□ 2.3
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