RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496764.6

ARHGEF4-210, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF4, Length 840 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4-210ENST00000496764 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.74■■■■■ 5.55
ARHGEF4-210ENST00000496764 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.17■■■■■ 4.66
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCC9O60706 1549 aa43.33■■■■■ 4.53
ARHGEF4-210ENST00000496764 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.62■■■■■ 4.25
ARHGEF4-210ENST00000496764 NACADO15069 1562 aa41.59■■■■■ 4.25
ARHGEF4-210ENST00000496764 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.51■■■■■ 4.24
ARHGEF4-210ENST00000496764 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
ARHGEF4-210ENST00000496764 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.35■■■■■ 4.21
ARHGEF4-210ENST00000496764 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.15■■■■■ 4.18
ARHGEF4-210ENST00000496764 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.64■■■■■ 4.1
ARHGEF4-210ENST00000496764 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.5■■■■■ 4.07
ARHGEF4-210ENST00000496764 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.44■■■■■ 4.06
ARHGEF4-210ENST00000496764 SCRIBQ14160 1630 aa40.32■■■■■ 4.05
ARHGEF4-210ENST00000496764 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.96■■■■□ 3.99
ARHGEF4-210ENST00000496764 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.91■■■■□ 3.98
ARHGEF4-210ENST00000496764 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
ARHGEF4-210ENST00000496764 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.18■■■■□ 3.86
ARHGEF4-210ENST00000496764 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF4-210ENST00000496764 SMARCA4P51532 1647 aa38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF4-210ENST00000496764 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
ARHGEF4-210ENST00000496764 NCAPD3P42695 1498 aa38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF4-210ENST00000496764 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.42■■■■□ 3.74
ARHGEF4-210ENST00000496764 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.34■■■■□ 3.73
ARHGEF4-210ENST00000496764 SMARCA2P51531 1590 aa38.32■■■■□ 3.73
ARHGEF4-210ENST00000496764 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.23■■■■□ 3.71
ARHGEF4-210ENST00000496764 HMGXB3Q12766 1538 aa38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF4-210ENST00000496764 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.06■■■■□ 3.68
ARHGEF4-210ENST00000496764 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF4-210ENST00000496764 WIZO95785 1651 aa37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF4-210ENST00000496764 NESP48681 1621 aa37.5■■■■□ 3.59
ARHGEF4-210ENST00000496764 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
ARHGEF4-210ENST00000496764 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.35■■■■□ 3.57
ARHGEF4-210ENST00000496764 ERCC6Q03468 1493 aa37.31■■■■□ 3.56
ARHGEF4-210ENST00000496764 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.28■■■■□ 3.56
ARHGEF4-210ENST00000496764 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.11■■■■□ 3.53
ARHGEF4-210ENST00000496764 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.07■■■■□ 3.53
ARHGEF4-210ENST00000496764 CFTRP13569 1480 aa37.06■■■■□ 3.52
ARHGEF4-210ENST00000496764 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.99■■■■□ 3.51
ARHGEF4-210ENST00000496764 CUX2O14529 1486 aa36.97■■■■□ 3.51
ARHGEF4-210ENST00000496764 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
ARHGEF4-210ENST00000496764 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.83■■■■□ 3.49
ARHGEF4-210ENST00000496764 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
ARHGEF4-210ENST00000496764 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.77■■■■□ 3.48
ARHGEF4-210ENST00000496764 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.75■■■■□ 3.47
ARHGEF4-210ENST00000496764 WDR62O43379 1518 aa36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF4-210ENST00000496764 PRDM2Q13029 1718 aa36.64■■■■□ 3.46
ARHGEF4-210ENST00000496764 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
ARHGEF4-210ENST00000496764 TOPBP1Q92547 1522 aa36.24■■■■□ 3.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCC8Q09428 1581 aa36.2■■■■□ 3.39
ARHGEF4-210ENST00000496764 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.18■■■■□ 3.38
ARHGEF4-210ENST00000496764 IFT140Q96RY7 1462 aa36.02■■■■□ 3.36
ARHGEF4-210ENST00000496764 CUX1P39880 1505 aa35.97■■■■□ 3.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.95■■■■□ 3.35
ARHGEF4-210ENST00000496764 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
ARHGEF4-210ENST00000496764 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.84■■■■□ 3.33
ARHGEF4-210ENST00000496764 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.8■■■■□ 3.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 SOGA1O94964 1423 aa35.78■■■■□ 3.32
ARHGEF4-210ENST00000496764 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
ARHGEF4-210ENST00000496764 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
ARHGEF4-210ENST00000496764 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
ARHGEF4-210ENST00000496764 SYNJ1O43426 1573 aa35.62■■■■□ 3.29
ARHGEF4-210ENST00000496764 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF4-210ENST00000496764 TOP2BQ02880 1626 aa35.61■■■■□ 3.29
ARHGEF4-210ENST00000496764 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.59■■■■□ 3.29
ARHGEF4-210ENST00000496764 WDR97A6NE52 1622 aa35.53■■■■□ 3.28
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.5■■■■□ 3.27
ARHGEF4-210ENST00000496764 OSCARQ8IYS5 282 aa35.43■■■■□ 3.26
ARHGEF4-210ENST00000496764 GRIN2BQ13224 1484 aa35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF4-210ENST00000496764 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.36■■■■□ 3.25
ARHGEF4-210ENST00000496764 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.34■■■■□ 3.25
ARHGEF4-210ENST00000496764 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.33■■■■□ 3.25
ARHGEF4-210ENST00000496764 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
ARHGEF4-210ENST00000496764 PBRM1Q86U86 1689 aa35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF4-210ENST00000496764 CHD1O14646 1710 aa35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF4-210ENST00000496764 FBLN2P98095 1184 aa35.2■■■■□ 3.23
ARHGEF4-210ENST00000496764 SYNJ2O15056 1496 aa35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF4-210ENST00000496764 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF4-210ENST00000496764 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF4-210ENST00000496764 ADAMTS12P58397 1594 aa35■■■■□ 3.19
ARHGEF4-210ENST00000496764 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF4-210ENST00000496764 KIF27Q86VH2 1401 aa34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF4-210ENST00000496764 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF4-210ENST00000496764 GRIN2AQ12879 1464 aa34.92■■■■□ 3.18
ARHGEF4-210ENST00000496764 ARHGEF11O15085 1522 aa34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF4-210ENST00000496764 IGF1RP08069 1367 aa34.86■■■■□ 3.17
ARHGEF4-210ENST00000496764 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
ARHGEF4-210ENST00000496764 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
ARHGEF4-210ENST00000496764 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.85■■■■□ 3.17
ARHGEF4-210ENST00000496764 NUP160Q12769 1436 aa34.8■■■■□ 3.16
ARHGEF4-210ENST00000496764 TRIM41Q8WV44 630 aa34.78■■■■□ 3.16
ARHGEF4-210ENST00000496764 CEP170Q5SW79 1584 aa34.74■■■■□ 3.15
ARHGEF4-210ENST00000496764 CUL7Q14999 1698 aa34.67■■■■□ 3.14
ARHGEF4-210ENST00000496764 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.65■■■■□ 3.14
ARHGEF4-210ENST00000496764 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.62■■■■□ 3.13
ARHGEF4-210ENST00000496764 ARAP1Q96P48 1450 aa34.6■■■■□ 3.13
ARHGEF4-210ENST00000496764 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.53■■■■□ 3.12
ARHGEF4-210ENST00000496764 SHROOM2Q13796 1616 aa34.51■■■■□ 3.11
ARHGEF4-210ENST00000496764 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.45■■■■□ 3.11
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