RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496507.1

RPS29P11-201, Transcript of ribosomal protein S29 pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene RPS29P11, Length 171 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P11-201ENST00000496507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PBRM1Q86U86 1689 aa3.33□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 DPYSL4O14531 572 aa3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 SAMD7Q7Z3H4 446 aa3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 NKX2-3Q8TAU0 364 aa3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 ERCC6Q03468 1493 aa3.32□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 SMAPO00193 183 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 TRIM67Q6ZTA4 783 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PACS2Q86VP3 889 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 DDX12PQ92771 950 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.31□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 APLP1P51693 650 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PRSS12P56730 875 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 CDCA7LQ96GN5 454 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 CHD1O14646 1710 aa3.3□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 SOGA1O94964 1423 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 TATDN2Q93075 761 aa3.29□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 POTECB2RU33 542 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 MAP3K7O43318 606 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 NBR1Q14596 966 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 ADAMTS12P58397 1594 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.28□□□□□ -1.88
RPS29P11-201ENST00000496507 MYT1Q01538 1121 aa3.27□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PDIA6Q15084 440 aa3.27□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 TMUB1Q9BVT8 246 aa3.27□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PNMA3Q9UL41 463 aa3.27□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 CEP170Q5SW79 1584 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 DGAT1O75907 488 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 TTC13Q8NBP0 860 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 CERKQ8TCT0 537 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa3.26□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 ERCC6L2Q5T890 1561 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 IFT140Q96RY7 1462 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 NBPF26B4DH59 902 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 RNF223E7ERA6 249 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 GGCXP38435 758 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SLC19A1P41440 591 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 COPS2P61201 443 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 NUDT18Q6ZVK8 323 aa3.25□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 ZPR1O75312 459 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PRR20EP86478 221 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PRR20CP86479 221 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PRR20DP86480 221 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PRR20BP86481 221 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PRR20AP86496 221 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SPRYD7Q5W111 196 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 TREML4Q6UXN2 200 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 CDHR5Q9HBB8 845 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 CLASP1Q7Z460 1538 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa3.24□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 GAPVD1Q14C86 1478 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 GDF9O60383 454 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 OSBPP22059 807 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 LIAT1Q6ZQX7 453 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 RNF40O75150 1001 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PKDCCQ504Y2 493 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SLF2Q8IX21 1173 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 EYA1Q99502 592 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 AAASQ9NRG9 546 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 CUL7Q14999 1698 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 KIF21BO75037 1637 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 SHROOM2Q13796 1616 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 PRXQ9BXM0 1461 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS29P11-201ENST00000496507 GRXCR2A6NFK2 248 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 TLL1O43897 1013 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 HDGFP51858 240 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 PADI6Q6TGC4 694 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 ANKLE1Q8NAG6 615 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 NECTIN2Q92692 538 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 IGF1RP08069 1367 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 GRIN2AQ12879 1464 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 GRIN2BQ13224 1484 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 FAM187AA6NFU0 413 aa3.2□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 TNFRSF10AO00220 468 aa3.2□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 ST8SIA5O15466 376 aa3.2□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 ZNF697Q5TEC3 545 aa3.2□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa3.2□□□□□ -1.9
RPS29P11-201ENST00000496507 SYNJ2O15056 1496 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms