RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495174.5

SH3BP1-208, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 947 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-208ENST00000495174 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP1-208ENST00000495174 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SH3BP1-208ENST00000495174 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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SH3BP1-208ENST00000495174 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-208ENST00000495174 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP1-208ENST00000495174 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP1-208ENST00000495174 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP1-208ENST00000495174 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP1-208ENST00000495174 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.21■□□□□ 0.83
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SH3BP1-208ENST00000495174 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.16■□□□□ 0.82
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SH3BP1-208ENST00000495174 C14orf37Q86TY3 774 aa20.05■□□□□ 0.8
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SH3BP1-208ENST00000495174 HSPA1LP34931 641 aa20.01■□□□□ 0.79
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SH3BP1-208ENST00000495174 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1-208ENST00000495174 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP1-208ENST00000495174 ADGRB1O14514 1584 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1-208ENST00000495174 DLC1Q96QB1 1528 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1-208ENST00000495174 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1-208ENST00000495174 STK26Q9P289 416 aa19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-208ENST00000495174 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1-208ENST00000495174 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP1-208ENST00000495174 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
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SH3BP1-208ENST00000495174 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP1-208ENST00000495174 C1orf167Q5SNV9 1468 aa19.85■□□□□ 0.77
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