RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 CLTCL1P53675 1640 aa25.55■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.55■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.54■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.53■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.52■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
USP20-208ENST00000494971 KCNA6P17658 529 aa25.49■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 KIF1BO60333 1816 aa25.48■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 NWD1Q149M9 1564 aa25.48■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 BCANQ96GW7 911 aa25.47■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.46■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.46■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 TBX22Q9Y458 520 aa25.46■■□□□ 1.67
USP20-208ENST00000494971 DIP2AQ14689 1571 aa25.45■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.44■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 TOM1O60784 492 aa25.44■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.43■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 ALKQ9UM73 1620 aa25.43■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 FOXD1Q16676 465 aa25.42■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.4■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 PIK3R4Q99570 1358 aa25.4■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.4■■□□□ 1.66
USP20-208ENST00000494971 TMEM94Q12767 1356 aa25.38■■□□□ 1.65
USP20-208ENST00000494971 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.36■■□□□ 1.65
USP20-208ENST00000494971 HRCP23327 699 aa25.35■■□□□ 1.65
USP20-208ENST00000494971 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
USP20-208ENST00000494971 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.35■■□□□ 1.65
USP20-208ENST00000494971 PIP4K2BP78356 416 aa25.32■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.31■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 PPLO60437 1756 aa25.3■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 PTPRUQ92729 1446 aa25.29■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.29■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
USP20-208ENST00000494971 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.25■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 METP08581 1390 aa25.25■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 MSH6P52701 1360 aa25.23■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 HSPA1LP34931 641 aa25.23■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 IFT172Q9UG01 1749 aa25.22■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.2■■□□□ 1.63
USP20-208ENST00000494971 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.2■■□□□ 1.62
USP20-208ENST00000494971 RGL3Q3MIN7 710 aa25.19■■□□□ 1.62
USP20-208ENST00000494971 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.15■■□□□ 1.62
USP20-208ENST00000494971 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.15■■□□□ 1.62
USP20-208ENST00000494971 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.14■■□□□ 1.62
USP20-208ENST00000494971 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 C14orf37Q86TY3 774 aa25.12■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 PTCH1Q13635 1447 aa25.12■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.11■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 SLAIN2Q9P270 581 aa25.11■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 PIK3C2GO75747 1445 aa25.11■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.1■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 DCCP43146 1447 aa25.1■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.09■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 MYOM2P54296 1465 aa25.09■■□□□ 1.61
USP20-208ENST00000494971 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 ATF3P18847 181 aa25.06■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.05■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.03■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.03■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.02■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 TECPR2O15040 1411 aa25.02■■□□□ 1.6
USP20-208ENST00000494971 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 LAMC1P11047 1609 aa24.99■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 MST1RQ04912 1400 aa24.98■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 ABCC11Q96J66 1382 aa24.98■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.98■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.96■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 STAC3Q96MF2 364 aa24.96■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
USP20-208ENST00000494971 PHLPP1O60346 1717 aa24.95■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.94■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 BRINP3Q76B58 766 aa24.93■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.92■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 STK26Q9P289 416 aa24.92■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 SIRT1Q96EB6 747 aa24.9■■□□□ 1.58
USP20-208ENST00000494971 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.89■■□□□ 1.57
USP20-208ENST00000494971 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.88■■□□□ 1.57
USP20-208ENST00000494971 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.88■■□□□ 1.57
USP20-208ENST00000494971 ADGRB1O14514 1584 aa24.88■■□□□ 1.57
USP20-208ENST00000494971 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.87■■□□□ 1.57
USP20-208ENST00000494971 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.86■■□□□ 1.57
USP20-208ENST00000494971 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
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