RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 BCANQ96GW7 911 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 TOM1O60784 492 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP4-211ENST00000493436 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 PIP4K2BP78356 416 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNA6P17658 529 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 TRPM2O94759 1503 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 CLTCL1P53675 1640 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 ALKQ9UM73 1620 aa25.08■■□□□ 1.61
SH3BP4-211ENST00000493436 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF1BO60333 1816 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 NWD1Q149M9 1564 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TBX22Q9Y458 520 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM94Q12767 1356 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-211ENST00000493436 DIP2AQ14689 1571 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 HSPA1LP34931 641 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 FOXD1Q16676 465 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP4-211ENST00000493436 PIK3R4Q99570 1358 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 MSH6P52701 1360 aa24.9■■□□□ 1.58
SH3BP4-211ENST00000493436 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.88■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRUQ92729 1446 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PPLO60437 1756 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 C14orf37Q86TY3 774 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 METP08581 1390 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SLAIN2Q9P270 581 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 RGL3Q3MIN7 710 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-211ENST00000493436 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 ATF3P18847 181 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 IFT172Q9UG01 1749 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 ILDR2Q71H61 639 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.7■■□□□ 1.55
SH3BP4-211ENST00000493436 HRCP23327 699 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 PHLPP1O60346 1717 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 DCCP43146 1447 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 PTCH1Q13635 1447 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP4-211ENST00000493436 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 PIK3C2GO75747 1445 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 MST1RQ04912 1400 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 BRINP3Q76B58 766 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4-211ENST00000493436 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 STK26Q9P289 416 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 MYOM2P54296 1465 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 JCADQ9P266 1359 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 TECPR2O15040 1411 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP4-211ENST00000493436 LAMC1P11047 1609 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC11Q96J66 1382 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 SOCS7O14512 581 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 SHPRHQ149N8 1683 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4-211ENST00000493436 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
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