RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
AGRN-209ENST00000492947 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.54■■□□□ 1.68
AGRN-209ENST00000492947 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.53■■□□□ 1.68
AGRN-209ENST00000492947 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.52■■□□□ 1.68
AGRN-209ENST00000492947 KCNA6P17658 529 aa25.51■■□□□ 1.67
AGRN-209ENST00000492947 HSPA1LP34931 641 aa25.51■■□□□ 1.67
AGRN-209ENST00000492947 PIP4K2BP78356 416 aa25.5■■□□□ 1.67
AGRN-209ENST00000492947 NWD1Q149M9 1564 aa25.5■■□□□ 1.67
AGRN-209ENST00000492947 HFM1A2PYH4 1435 aa25.48■■□□□ 1.67
AGRN-209ENST00000492947 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.46■■□□□ 1.67
AGRN-209ENST00000492947 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.45■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 TMEM94Q12767 1356 aa25.44■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 TBX22Q9Y458 520 aa25.43■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.43■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 ILDR2Q71H61 639 aa25.42■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
AGRN-209ENST00000492947 TRPM2O94759 1503 aa25.37■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 DIP2AQ14689 1571 aa25.35■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 CLTCL1P53675 1640 aa25.35■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.34■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.34■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 BCANQ96GW7 911 aa25.33■■□□□ 1.65
AGRN-209ENST00000492947 PIK3R4Q99570 1358 aa25.32■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.31■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 PTPRUQ92729 1446 aa25.3■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.29■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 TRIM52Q96A61 297 aa25.29■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.29■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
AGRN-209ENST00000492947 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 MSH6P52701 1360 aa25.23■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 METP08581 1390 aa25.21■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.21■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.21■■□□□ 1.63
AGRN-209ENST00000492947 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
AGRN-209ENST00000492947 SLAIN2Q9P270 581 aa25.2■■□□□ 1.62
AGRN-209ENST00000492947 KIF1BO60333 1816 aa25.18■■□□□ 1.62
AGRN-209ENST00000492947 SOCS7O14512 581 aa25.15■■□□□ 1.62
AGRN-209ENST00000492947 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.15■■□□□ 1.62
AGRN-209ENST00000492947 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
AGRN-209ENST00000492947 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.13■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.12■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.11■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 KCNA4P22459 653 aa25.08■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.08■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 DCCP43146 1447 aa25.08■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.08■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.08■■□□□ 1.61
AGRN-209ENST00000492947 PPLO60437 1756 aa25.08■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.03■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 ATF3P18847 181 aa25.03■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 C14orf37Q86TY3 774 aa25.03■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 MST1RQ04912 1400 aa25.02■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 PTCH1Q13635 1447 aa25.02■■□□□ 1.6
AGRN-209ENST00000492947 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 PHLPP1O60346 1717 aa25.01■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.01■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.01■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 BRINP3Q76B58 766 aa25■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 IFT172Q9UG01 1749 aa24.98■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.98■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 JCADQ9P266 1359 aa24.96■■□□□ 1.59
AGRN-209ENST00000492947 HRCP23327 699 aa24.95■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.94■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.94■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 RGL3Q3MIN7 710 aa24.93■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 PIK3C2GO75747 1445 aa24.92■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.89■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 TECPR2O15040 1411 aa24.89■■□□□ 1.58
AGRN-209ENST00000492947 LRP6O75581 1613 aa24.89■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.89■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.87■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 SHPRHQ149N8 1683 aa24.87■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.86■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 POTEAQ6S8J7 498 aa24.85■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 LAMC1P11047 1609 aa24.85■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 ABCC11Q96J66 1382 aa24.84■■□□□ 1.57
AGRN-209ENST00000492947 MYOM2P54296 1465 aa24.83■■□□□ 1.56
AGRN-209ENST00000492947 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
AGRN-209ENST00000492947 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
AGRN-209ENST00000492947 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.81■■□□□ 1.56
AGRN-209ENST00000492947 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
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